Protein–RNA interactions for Protein: Q99NC0

Vgll1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll1Q99NC0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vgll1Q99NC0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Vgll1Q99NC0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vgll1Q99NC0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vgll1Q99NC0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vgll1Q99NC0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vgll1Q99NC0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vgll1Q99NC0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vgll1Q99NC0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vgll1Q99NC0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vgll1Q99NC0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vgll1Q99NC0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vgll1Q99NC0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vgll1Q99NC0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vgll1Q99NC0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vgll1Q99NC0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vgll1Q99NC0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vgll1Q99NC0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Vgll1Q99NC0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vgll1Q99NC0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vgll1Q99NC0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vgll1Q99NC0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vgll1Q99NC0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vgll1Q99NC0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vgll1Q99NC0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vgll1Q99NC0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vgll1Q99NC0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vgll1Q99NC0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vgll1Q99NC0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vgll1Q99NC0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vgll1Q99NC0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Vgll1Q99NC0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vgll1Q99NC0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vgll1Q99NC0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vgll1Q99NC0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vgll1Q99NC0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vgll1Q99NC0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vgll1Q99NC0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vgll1Q99NC0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vgll1Q99NC0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vgll1Q99NC0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vgll1Q99NC0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vgll1Q99NC0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vgll1Q99NC0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vgll1Q99NC0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vgll1Q99NC0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vgll1Q99NC0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vgll1Q99NC0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vgll1Q99NC0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vgll1Q99NC0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vgll1Q99NC0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vgll1Q99NC0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Vgll1Q99NC0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vgll1Q99NC0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Vgll1Q99NC0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vgll1Q99NC0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vgll1Q99NC0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vgll1Q99NC0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vgll1Q99NC0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vgll1Q99NC0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vgll1Q99NC0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vgll1Q99NC0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Vgll1Q99NC0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vgll1Q99NC0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vgll1Q99NC0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vgll1Q99NC0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vgll1Q99NC0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vgll1Q99NC0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vgll1Q99NC0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vgll1Q99NC0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vgll1Q99NC0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vgll1Q99NC0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vgll1Q99NC0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vgll1Q99NC0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vgll1Q99NC0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vgll1Q99NC0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vgll1Q99NC0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vgll1Q99NC0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vgll1Q99NC0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vgll1Q99NC0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vgll1Q99NC0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vgll1Q99NC0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vgll1Q99NC0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vgll1Q99NC0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vgll1Q99NC0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vgll1Q99NC0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vgll1Q99NC0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vgll1Q99NC0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vgll1Q99NC0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vgll1Q99NC0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vgll1Q99NC0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vgll1Q99NC0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vgll1Q99NC0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vgll1Q99NC0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vgll1Q99NC0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vgll1Q99NC0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vgll1Q99NC0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vgll1Q99NC0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vgll1Q99NC0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vgll1Q99NC0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms