Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Brms1Q99N20 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Brms1Q99N20 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Brms1Q99N20 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Brms1Q99N20 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Brms1Q99N20 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Brms1Q99N20 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Brms1Q99N20 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Brms1Q99N20 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brms1Q99N20 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brms1Q99N20 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brms1Q99N20 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brms1Q99N20 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brms1Q99N20 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brms1Q99N20 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brms1Q99N20 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brms1Q99N20 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Brms1Q99N20 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Brms1Q99N20 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Brms1Q99N20 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Brms1Q99N20 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Brms1Q99N20 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Brms1Q99N20 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Brms1Q99N20 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Brms1Q99N20 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Brms1Q99N20 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brms1Q99N20 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brms1Q99N20 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brms1Q99N20 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brms1Q99N20 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brms1Q99N20 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brms1Q99N20 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brms1Q99N20 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Brms1Q99N20 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Brms1Q99N20 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Brms1Q99N20 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Brms1Q99N20 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Brms1Q99N20 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Brms1Q99N20 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Brms1Q99N20 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Brms1Q99N20 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Brms1Q99N20 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Brms1Q99N20 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Brms1Q99N20 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Brms1Q99N20 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Brms1Q99N20 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Brms1Q99N20 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brms1Q99N20 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brms1Q99N20 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brms1Q99N20 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brms1Q99N20 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brms1Q99N20 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brms1Q99N20 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brms1Q99N20 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brms1Q99N20 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brms1Q99N20 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brms1Q99N20 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brms1Q99N20 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brms1Q99N20 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brms1Q99N20 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brms1Q99N20 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brms1Q99N20 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Brms1Q99N20 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Brms1Q99N20 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Brms1Q99N20 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Brms1Q99N20 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Brms1Q99N20 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Brms1Q99N20 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Brms1Q99N20 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Brms1Q99N20 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Brms1Q99N20 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Brms1Q99N20 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Brms1Q99N20 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Brms1Q99N20 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Brms1Q99N20 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Brms1Q99N20 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Brms1Q99N20 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Brms1Q99N20 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Brms1Q99N20 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Brms1Q99N20 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Brms1Q99N20 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Brms1Q99N20 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Brms1Q99N20 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Brms1Q99N20 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Brms1Q99N20 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Brms1Q99N20 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Brms1Q99N20 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Brms1Q99N20 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Brms1Q99N20 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Brms1Q99N20 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Brms1Q99N20 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Brms1Q99N20 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Brms1Q99N20 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Brms1Q99N20 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Brms1Q99N20 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Brms1Q99N20 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Brms1Q99N20 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Brms1Q99N20 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Brms1Q99N20 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Brms1Q99N20 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms