Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ms4a4dQ99N05 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ms4a4dQ99N05 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ms4a4dQ99N05 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ms4a4dQ99N05 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ms4a4dQ99N05 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ms4a4dQ99N05 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ms4a4dQ99N05 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ms4a4dQ99N05 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ms4a4dQ99N05 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ms4a4dQ99N05 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ms4a4dQ99N05 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ms4a4dQ99N05 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ms4a4dQ99N05 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ms4a4dQ99N05 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ms4a4dQ99N05 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ms4a4dQ99N05 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ms4a4dQ99N05 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ms4a4dQ99N05 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ms4a4dQ99N05 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ms4a4dQ99N05 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ms4a4dQ99N05 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ms4a4dQ99N05 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ms4a4dQ99N05 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ms4a4dQ99N05 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ms4a4dQ99N05 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ms4a4dQ99N05 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ms4a4dQ99N05 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ms4a4dQ99N05 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ms4a4dQ99N05 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ms4a4dQ99N05 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ms4a4dQ99N05 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ms4a4dQ99N05 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ms4a4dQ99N05 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ms4a4dQ99N05 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ms4a4dQ99N05 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ms4a4dQ99N05 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ms4a4dQ99N05 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ms4a4dQ99N05 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ms4a4dQ99N05 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ms4a4dQ99N05 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ms4a4dQ99N05 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ms4a4dQ99N05 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ms4a4dQ99N05 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ms4a4dQ99N05 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ms4a4dQ99N05 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ms4a4dQ99N05 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ms4a4dQ99N05 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ms4a4dQ99N05 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ms4a4dQ99N05 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ms4a4dQ99N05 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ms4a4dQ99N05 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ms4a4dQ99N05 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ms4a4dQ99N05 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ms4a4dQ99N05 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ms4a4dQ99N05 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ms4a4dQ99N05 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ms4a4dQ99N05 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ms4a4dQ99N05 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ms4a4dQ99N05 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ms4a4dQ99N05 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ms4a4dQ99N05 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ms4a4dQ99N05 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ms4a4dQ99N05 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ms4a4dQ99N05 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ms4a4dQ99N05 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ms4a4dQ99N05 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ms4a4dQ99N05 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ms4a4dQ99N05 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ms4a4dQ99N05 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ms4a4dQ99N05 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ms4a4dQ99N05 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ms4a4dQ99N05 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ms4a4dQ99N05 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ms4a4dQ99N05 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ms4a4dQ99N05 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ms4a4dQ99N05 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ms4a4dQ99N05 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ms4a4dQ99N05 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ms4a4dQ99N05 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ms4a4dQ99N05 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ms4a4dQ99N05 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ms4a4dQ99N05 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ms4a4dQ99N05 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ms4a4dQ99N05 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ms4a4dQ99N05 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ms4a4dQ99N05 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ms4a4dQ99N05 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ms4a4dQ99N05 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ms4a4dQ99N05 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ms4a4dQ99N05 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ms4a4dQ99N05 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ms4a4dQ99N05 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ms4a4dQ99N05 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ms4a4dQ99N05 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ms4a4dQ99N05 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ms4a4dQ99N05 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ms4a4dQ99N05 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ms4a4dQ99N05 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ms4a4dQ99N05 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms