Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR3

Slc12a9, Solute carrier family 12 member 9, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a9Q99MR3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc12a9Q99MR3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc12a9Q99MR3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc12a9Q99MR3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc12a9Q99MR3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc12a9Q99MR3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc12a9Q99MR3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc12a9Q99MR3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc12a9Q99MR3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc12a9Q99MR3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc12a9Q99MR3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc12a9Q99MR3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc12a9Q99MR3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc12a9Q99MR3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc12a9Q99MR3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc12a9Q99MR3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc12a9Q99MR3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc12a9Q99MR3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc12a9Q99MR3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc12a9Q99MR3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc12a9Q99MR3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc12a9Q99MR3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc12a9Q99MR3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc12a9Q99MR3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc12a9Q99MR3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc12a9Q99MR3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc12a9Q99MR3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc12a9Q99MR3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc12a9Q99MR3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc12a9Q99MR3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc12a9Q99MR3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc12a9Q99MR3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc12a9Q99MR3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc12a9Q99MR3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc12a9Q99MR3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc12a9Q99MR3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc12a9Q99MR3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc12a9Q99MR3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc12a9Q99MR3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc12a9Q99MR3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc12a9Q99MR3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc12a9Q99MR3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc12a9Q99MR3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc12a9Q99MR3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc12a9Q99MR3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc12a9Q99MR3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc12a9Q99MR3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc12a9Q99MR3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc12a9Q99MR3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc12a9Q99MR3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc12a9Q99MR3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc12a9Q99MR3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc12a9Q99MR3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc12a9Q99MR3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc12a9Q99MR3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc12a9Q99MR3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc12a9Q99MR3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc12a9Q99MR3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc12a9Q99MR3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc12a9Q99MR3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc12a9Q99MR3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc12a9Q99MR3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc12a9Q99MR3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc12a9Q99MR3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc12a9Q99MR3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc12a9Q99MR3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc12a9Q99MR3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc12a9Q99MR3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc12a9Q99MR3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc12a9Q99MR3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc12a9Q99MR3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc12a9Q99MR3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc12a9Q99MR3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc12a9Q99MR3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc12a9Q99MR3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc12a9Q99MR3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc12a9Q99MR3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc12a9Q99MR3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc12a9Q99MR3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc12a9Q99MR3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc12a9Q99MR3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc12a9Q99MR3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc12a9Q99MR3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc12a9Q99MR3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc12a9Q99MR3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc12a9Q99MR3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc12a9Q99MR3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc12a9Q99MR3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc12a9Q99MR3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc12a9Q99MR3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc12a9Q99MR3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc12a9Q99MR3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc12a9Q99MR3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc12a9Q99MR3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc12a9Q99MR3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc12a9Q99MR3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc12a9Q99MR3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc12a9Q99MR3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc12a9Q99MR3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc12a9Q99MR3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms