Protein–RNA interactions for Protein: Q99MP3

Calcb, Calcitonin gene-related peptide 2, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CalcbQ99MP3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CalcbQ99MP3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CalcbQ99MP3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CalcbQ99MP3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CalcbQ99MP3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CalcbQ99MP3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CalcbQ99MP3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CalcbQ99MP3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CalcbQ99MP3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CalcbQ99MP3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CalcbQ99MP3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CalcbQ99MP3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CalcbQ99MP3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CalcbQ99MP3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CalcbQ99MP3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CalcbQ99MP3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CalcbQ99MP3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CalcbQ99MP3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CalcbQ99MP3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CalcbQ99MP3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CalcbQ99MP3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CalcbQ99MP3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CalcbQ99MP3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CalcbQ99MP3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CalcbQ99MP3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CalcbQ99MP3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CalcbQ99MP3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CalcbQ99MP3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CalcbQ99MP3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CalcbQ99MP3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CalcbQ99MP3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CalcbQ99MP3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CalcbQ99MP3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CalcbQ99MP3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CalcbQ99MP3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CalcbQ99MP3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CalcbQ99MP3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CalcbQ99MP3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CalcbQ99MP3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CalcbQ99MP3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CalcbQ99MP3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CalcbQ99MP3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CalcbQ99MP3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CalcbQ99MP3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CalcbQ99MP3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CalcbQ99MP3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CalcbQ99MP3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CalcbQ99MP3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CalcbQ99MP3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CalcbQ99MP3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CalcbQ99MP3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CalcbQ99MP3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CalcbQ99MP3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CalcbQ99MP3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CalcbQ99MP3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CalcbQ99MP3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CalcbQ99MP3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CalcbQ99MP3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CalcbQ99MP3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CalcbQ99MP3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CalcbQ99MP3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CalcbQ99MP3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CalcbQ99MP3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CalcbQ99MP3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CalcbQ99MP3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CalcbQ99MP3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CalcbQ99MP3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CalcbQ99MP3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CalcbQ99MP3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CalcbQ99MP3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CalcbQ99MP3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CalcbQ99MP3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CalcbQ99MP3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CalcbQ99MP3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CalcbQ99MP3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CalcbQ99MP3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CalcbQ99MP3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CalcbQ99MP3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CalcbQ99MP3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CalcbQ99MP3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CalcbQ99MP3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CalcbQ99MP3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CalcbQ99MP3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CalcbQ99MP3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CalcbQ99MP3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CalcbQ99MP3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CalcbQ99MP3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CalcbQ99MP3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CalcbQ99MP3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CalcbQ99MP3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CalcbQ99MP3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CalcbQ99MP3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CalcbQ99MP3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CalcbQ99MP3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CalcbQ99MP3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CalcbQ99MP3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CalcbQ99MP3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CalcbQ99MP3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CalcbQ99MP3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CalcbQ99MP3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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