Protein–RNA interactions for Protein: Q99MN9

Pccb, Propionyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PccbQ99MN9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PccbQ99MN9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PccbQ99MN9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PccbQ99MN9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PccbQ99MN9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PccbQ99MN9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PccbQ99MN9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PccbQ99MN9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PccbQ99MN9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PccbQ99MN9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PccbQ99MN9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PccbQ99MN9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PccbQ99MN9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PccbQ99MN9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PccbQ99MN9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PccbQ99MN9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PccbQ99MN9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PccbQ99MN9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PccbQ99MN9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PccbQ99MN9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PccbQ99MN9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PccbQ99MN9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PccbQ99MN9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PccbQ99MN9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PccbQ99MN9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PccbQ99MN9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PccbQ99MN9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PccbQ99MN9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PccbQ99MN9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PccbQ99MN9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PccbQ99MN9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PccbQ99MN9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PccbQ99MN9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PccbQ99MN9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PccbQ99MN9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
PccbQ99MN9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PccbQ99MN9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PccbQ99MN9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PccbQ99MN9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PccbQ99MN9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PccbQ99MN9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PccbQ99MN9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PccbQ99MN9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PccbQ99MN9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PccbQ99MN9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PccbQ99MN9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PccbQ99MN9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PccbQ99MN9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PccbQ99MN9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PccbQ99MN9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PccbQ99MN9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PccbQ99MN9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PccbQ99MN9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PccbQ99MN9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PccbQ99MN9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PccbQ99MN9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PccbQ99MN9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PccbQ99MN9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PccbQ99MN9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PccbQ99MN9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PccbQ99MN9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PccbQ99MN9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PccbQ99MN9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PccbQ99MN9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PccbQ99MN9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PccbQ99MN9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PccbQ99MN9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PccbQ99MN9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PccbQ99MN9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PccbQ99MN9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PccbQ99MN9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PccbQ99MN9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PccbQ99MN9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PccbQ99MN9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PccbQ99MN9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PccbQ99MN9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PccbQ99MN9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PccbQ99MN9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PccbQ99MN9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PccbQ99MN9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PccbQ99MN9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PccbQ99MN9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PccbQ99MN9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PccbQ99MN9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PccbQ99MN9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PccbQ99MN9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PccbQ99MN9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PccbQ99MN9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PccbQ99MN9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PccbQ99MN9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PccbQ99MN9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PccbQ99MN9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PccbQ99MN9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PccbQ99MN9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PccbQ99MN9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PccbQ99MN9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PccbQ99MN9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PccbQ99MN9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PccbQ99MN9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PccbQ99MN9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms