Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Atp1b4Q99ME6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Atp1b4Q99ME6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Atp1b4Q99ME6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Atp1b4Q99ME6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Atp1b4Q99ME6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Atp1b4Q99ME6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Atp1b4Q99ME6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Atp1b4Q99ME6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Atp1b4Q99ME6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Atp1b4Q99ME6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Atp1b4Q99ME6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Atp1b4Q99ME6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Atp1b4Q99ME6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Atp1b4Q99ME6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Atp1b4Q99ME6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Atp1b4Q99ME6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Atp1b4Q99ME6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Atp1b4Q99ME6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Atp1b4Q99ME6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Atp1b4Q99ME6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Atp1b4Q99ME6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Atp1b4Q99ME6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Atp1b4Q99ME6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Atp1b4Q99ME6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Atp1b4Q99ME6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Atp1b4Q99ME6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Atp1b4Q99ME6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Atp1b4Q99ME6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Atp1b4Q99ME6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Atp1b4Q99ME6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Atp1b4Q99ME6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Atp1b4Q99ME6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Atp1b4Q99ME6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Atp1b4Q99ME6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Atp1b4Q99ME6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Atp1b4Q99ME6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Atp1b4Q99ME6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Atp1b4Q99ME6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Atp1b4Q99ME6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Atp1b4Q99ME6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Atp1b4Q99ME6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Atp1b4Q99ME6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Atp1b4Q99ME6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Atp1b4Q99ME6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Atp1b4Q99ME6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Atp1b4Q99ME6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Atp1b4Q99ME6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Atp1b4Q99ME6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Atp1b4Q99ME6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Atp1b4Q99ME6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Atp1b4Q99ME6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Atp1b4Q99ME6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Atp1b4Q99ME6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Atp1b4Q99ME6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Atp1b4Q99ME6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Atp1b4Q99ME6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Atp1b4Q99ME6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Atp1b4Q99ME6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Atp1b4Q99ME6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Atp1b4Q99ME6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Atp1b4Q99ME6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Atp1b4Q99ME6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Atp1b4Q99ME6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Atp1b4Q99ME6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Atp1b4Q99ME6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Atp1b4Q99ME6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Atp1b4Q99ME6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Atp1b4Q99ME6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Atp1b4Q99ME6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Atp1b4Q99ME6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Atp1b4Q99ME6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Atp1b4Q99ME6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Atp1b4Q99ME6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Atp1b4Q99ME6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Atp1b4Q99ME6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Atp1b4Q99ME6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Atp1b4Q99ME6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Atp1b4Q99ME6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Atp1b4Q99ME6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Atp1b4Q99ME6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Atp1b4Q99ME6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Atp1b4Q99ME6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Atp1b4Q99ME6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Atp1b4Q99ME6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Atp1b4Q99ME6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Atp1b4Q99ME6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Atp1b4Q99ME6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Atp1b4Q99ME6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Atp1b4Q99ME6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Atp1b4Q99ME6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Atp1b4Q99ME6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Atp1b4Q99ME6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Atp1b4Q99ME6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Atp1b4Q99ME6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Atp1b4Q99ME6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Atp1b4Q99ME6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Atp1b4Q99ME6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Atp1b4Q99ME6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Atp1b4Q99ME6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms