Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Usp16Q99LG0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Usp16Q99LG0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Usp16Q99LG0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Usp16Q99LG0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Usp16Q99LG0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Usp16Q99LG0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Usp16Q99LG0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Usp16Q99LG0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Usp16Q99LG0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Usp16Q99LG0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Usp16Q99LG0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Usp16Q99LG0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Usp16Q99LG0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Usp16Q99LG0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Usp16Q99LG0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Usp16Q99LG0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Usp16Q99LG0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Usp16Q99LG0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Usp16Q99LG0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Usp16Q99LG0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Usp16Q99LG0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Usp16Q99LG0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Usp16Q99LG0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Usp16Q99LG0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Usp16Q99LG0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Usp16Q99LG0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Usp16Q99LG0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Usp16Q99LG0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Usp16Q99LG0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Usp16Q99LG0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Usp16Q99LG0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Usp16Q99LG0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Usp16Q99LG0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Usp16Q99LG0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Usp16Q99LG0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp16Q99LG0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp16Q99LG0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp16Q99LG0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp16Q99LG0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp16Q99LG0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp16Q99LG0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp16Q99LG0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Usp16Q99LG0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Usp16Q99LG0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Usp16Q99LG0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Usp16Q99LG0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Usp16Q99LG0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Usp16Q99LG0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Usp16Q99LG0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Usp16Q99LG0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Usp16Q99LG0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Usp16Q99LG0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Usp16Q99LG0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Usp16Q99LG0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Usp16Q99LG0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Usp16Q99LG0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Usp16Q99LG0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Usp16Q99LG0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Usp16Q99LG0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Usp16Q99LG0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Usp16Q99LG0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Usp16Q99LG0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Usp16Q99LG0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Usp16Q99LG0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Usp16Q99LG0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Usp16Q99LG0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Usp16Q99LG0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Usp16Q99LG0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Usp16Q99LG0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Usp16Q99LG0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Usp16Q99LG0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Usp16Q99LG0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Usp16Q99LG0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Usp16Q99LG0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Usp16Q99LG0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Usp16Q99LG0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Usp16Q99LG0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Usp16Q99LG0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Usp16Q99LG0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Usp16Q99LG0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Usp16Q99LG0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp16Q99LG0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp16Q99LG0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp16Q99LG0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp16Q99LG0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp16Q99LG0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp16Q99LG0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp16Q99LG0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp16Q99LG0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp16Q99LG0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp16Q99LG0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Usp16Q99LG0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Usp16Q99LG0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Usp16Q99LG0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Usp16Q99LG0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Usp16Q99LG0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Usp16Q99LG0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp16Q99LG0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp16Q99LG0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms