Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ubxn2aQ99KJ0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ubxn2aQ99KJ0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ubxn2aQ99KJ0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ubxn2aQ99KJ0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ubxn2aQ99KJ0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ubxn2aQ99KJ0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ubxn2aQ99KJ0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ubxn2aQ99KJ0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ubxn2aQ99KJ0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ubxn2aQ99KJ0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ubxn2aQ99KJ0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ubxn2aQ99KJ0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ubxn2aQ99KJ0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ubxn2aQ99KJ0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ubxn2aQ99KJ0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ubxn2aQ99KJ0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ubxn2aQ99KJ0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ubxn2aQ99KJ0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ubxn2aQ99KJ0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ubxn2aQ99KJ0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ubxn2aQ99KJ0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ubxn2aQ99KJ0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ubxn2aQ99KJ0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ubxn2aQ99KJ0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ubxn2aQ99KJ0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ubxn2aQ99KJ0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ubxn2aQ99KJ0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ubxn2aQ99KJ0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ubxn2aQ99KJ0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ubxn2aQ99KJ0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ubxn2aQ99KJ0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ubxn2aQ99KJ0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ubxn2aQ99KJ0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ubxn2aQ99KJ0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ubxn2aQ99KJ0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ubxn2aQ99KJ0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ubxn2aQ99KJ0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ubxn2aQ99KJ0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ubxn2aQ99KJ0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ubxn2aQ99KJ0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ubxn2aQ99KJ0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ubxn2aQ99KJ0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ubxn2aQ99KJ0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ubxn2aQ99KJ0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ubxn2aQ99KJ0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ubxn2aQ99KJ0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ubxn2aQ99KJ0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ubxn2aQ99KJ0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ubxn2aQ99KJ0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ubxn2aQ99KJ0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ubxn2aQ99KJ0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ubxn2aQ99KJ0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ubxn2aQ99KJ0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ubxn2aQ99KJ0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ubxn2aQ99KJ0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ubxn2aQ99KJ0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ubxn2aQ99KJ0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ubxn2aQ99KJ0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ubxn2aQ99KJ0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ubxn2aQ99KJ0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ubxn2aQ99KJ0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ubxn2aQ99KJ0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ubxn2aQ99KJ0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ubxn2aQ99KJ0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ubxn2aQ99KJ0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ubxn2aQ99KJ0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ubxn2aQ99KJ0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ubxn2aQ99KJ0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ubxn2aQ99KJ0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ubxn2aQ99KJ0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ubxn2aQ99KJ0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ubxn2aQ99KJ0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ubxn2aQ99KJ0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ubxn2aQ99KJ0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ubxn2aQ99KJ0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ubxn2aQ99KJ0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ubxn2aQ99KJ0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ubxn2aQ99KJ0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ubxn2aQ99KJ0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ubxn2aQ99KJ0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ubxn2aQ99KJ0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ubxn2aQ99KJ0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ubxn2aQ99KJ0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ubxn2aQ99KJ0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ubxn2aQ99KJ0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ubxn2aQ99KJ0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ubxn2aQ99KJ0 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ubxn2aQ99KJ0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ubxn2aQ99KJ0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ubxn2aQ99KJ0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ubxn2aQ99KJ0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ubxn2aQ99KJ0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ubxn2aQ99KJ0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ubxn2aQ99KJ0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms