Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TrabdQ99JY4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TrabdQ99JY4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TrabdQ99JY4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TrabdQ99JY4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TrabdQ99JY4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TrabdQ99JY4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TrabdQ99JY4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TrabdQ99JY4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TrabdQ99JY4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TrabdQ99JY4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TrabdQ99JY4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TrabdQ99JY4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TrabdQ99JY4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TrabdQ99JY4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TrabdQ99JY4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TrabdQ99JY4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TrabdQ99JY4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TrabdQ99JY4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TrabdQ99JY4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TrabdQ99JY4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TrabdQ99JY4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TrabdQ99JY4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TrabdQ99JY4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TrabdQ99JY4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TrabdQ99JY4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TrabdQ99JY4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TrabdQ99JY4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TrabdQ99JY4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TrabdQ99JY4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TrabdQ99JY4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
TrabdQ99JY4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TrabdQ99JY4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TrabdQ99JY4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
TrabdQ99JY4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
TrabdQ99JY4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TrabdQ99JY4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TrabdQ99JY4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TrabdQ99JY4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TrabdQ99JY4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TrabdQ99JY4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TrabdQ99JY4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TrabdQ99JY4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TrabdQ99JY4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TrabdQ99JY4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TrabdQ99JY4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TrabdQ99JY4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TrabdQ99JY4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TrabdQ99JY4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TrabdQ99JY4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TrabdQ99JY4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TrabdQ99JY4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TrabdQ99JY4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TrabdQ99JY4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TrabdQ99JY4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TrabdQ99JY4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TrabdQ99JY4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TrabdQ99JY4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TrabdQ99JY4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TrabdQ99JY4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TrabdQ99JY4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TrabdQ99JY4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TrabdQ99JY4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TrabdQ99JY4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TrabdQ99JY4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TrabdQ99JY4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TrabdQ99JY4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TrabdQ99JY4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TrabdQ99JY4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TrabdQ99JY4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TrabdQ99JY4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TrabdQ99JY4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TrabdQ99JY4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TrabdQ99JY4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TrabdQ99JY4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TrabdQ99JY4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TrabdQ99JY4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TrabdQ99JY4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TrabdQ99JY4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TrabdQ99JY4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TrabdQ99JY4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TrabdQ99JY4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TrabdQ99JY4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TrabdQ99JY4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TrabdQ99JY4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TrabdQ99JY4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TrabdQ99JY4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TrabdQ99JY4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TrabdQ99JY4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TrabdQ99JY4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TrabdQ99JY4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TrabdQ99JY4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TrabdQ99JY4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TrabdQ99JY4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TrabdQ99JY4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TrabdQ99JY4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TrabdQ99JY4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TrabdQ99JY4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TrabdQ99JY4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TrabdQ99JY4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms