Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT1

Gatb, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GatbQ99JT1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GatbQ99JT1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GatbQ99JT1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GatbQ99JT1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GatbQ99JT1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GatbQ99JT1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GatbQ99JT1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GatbQ99JT1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GatbQ99JT1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GatbQ99JT1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GatbQ99JT1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GatbQ99JT1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GatbQ99JT1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GatbQ99JT1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GatbQ99JT1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GatbQ99JT1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GatbQ99JT1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GatbQ99JT1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GatbQ99JT1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GatbQ99JT1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GatbQ99JT1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GatbQ99JT1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GatbQ99JT1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GatbQ99JT1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GatbQ99JT1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GatbQ99JT1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GatbQ99JT1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GatbQ99JT1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GatbQ99JT1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GatbQ99JT1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GatbQ99JT1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GatbQ99JT1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GatbQ99JT1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GatbQ99JT1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GatbQ99JT1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GatbQ99JT1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GatbQ99JT1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GatbQ99JT1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GatbQ99JT1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GatbQ99JT1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GatbQ99JT1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GatbQ99JT1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GatbQ99JT1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GatbQ99JT1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GatbQ99JT1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GatbQ99JT1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GatbQ99JT1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GatbQ99JT1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GatbQ99JT1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GatbQ99JT1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GatbQ99JT1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GatbQ99JT1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GatbQ99JT1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GatbQ99JT1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GatbQ99JT1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GatbQ99JT1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GatbQ99JT1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GatbQ99JT1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GatbQ99JT1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GatbQ99JT1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GatbQ99JT1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GatbQ99JT1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GatbQ99JT1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GatbQ99JT1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GatbQ99JT1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GatbQ99JT1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
GatbQ99JT1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GatbQ99JT1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
GatbQ99JT1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GatbQ99JT1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GatbQ99JT1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GatbQ99JT1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GatbQ99JT1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GatbQ99JT1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GatbQ99JT1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GatbQ99JT1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GatbQ99JT1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GatbQ99JT1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GatbQ99JT1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GatbQ99JT1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GatbQ99JT1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GatbQ99JT1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GatbQ99JT1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GatbQ99JT1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GatbQ99JT1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GatbQ99JT1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GatbQ99JT1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GatbQ99JT1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GatbQ99JT1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GatbQ99JT1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GatbQ99JT1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GatbQ99JT1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GatbQ99JT1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GatbQ99JT1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GatbQ99JT1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GatbQ99JT1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GatbQ99JT1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GatbQ99JT1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GatbQ99JT1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GatbQ99JT1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms