Protein–RNA interactions for Protein: Q99JH7

Clstn3, Calsyntenin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn3Q99JH7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clstn3Q99JH7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Clstn3Q99JH7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clstn3Q99JH7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clstn3Q99JH7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clstn3Q99JH7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clstn3Q99JH7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clstn3Q99JH7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clstn3Q99JH7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clstn3Q99JH7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clstn3Q99JH7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clstn3Q99JH7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clstn3Q99JH7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clstn3Q99JH7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Clstn3Q99JH7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clstn3Q99JH7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clstn3Q99JH7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Clstn3Q99JH7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clstn3Q99JH7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clstn3Q99JH7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clstn3Q99JH7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clstn3Q99JH7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clstn3Q99JH7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clstn3Q99JH7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clstn3Q99JH7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clstn3Q99JH7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clstn3Q99JH7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Clstn3Q99JH7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clstn3Q99JH7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clstn3Q99JH7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clstn3Q99JH7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clstn3Q99JH7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clstn3Q99JH7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clstn3Q99JH7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clstn3Q99JH7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clstn3Q99JH7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clstn3Q99JH7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clstn3Q99JH7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Clstn3Q99JH7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clstn3Q99JH7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clstn3Q99JH7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clstn3Q99JH7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clstn3Q99JH7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clstn3Q99JH7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clstn3Q99JH7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clstn3Q99JH7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clstn3Q99JH7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clstn3Q99JH7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clstn3Q99JH7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clstn3Q99JH7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Clstn3Q99JH7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clstn3Q99JH7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clstn3Q99JH7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clstn3Q99JH7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clstn3Q99JH7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clstn3Q99JH7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clstn3Q99JH7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clstn3Q99JH7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clstn3Q99JH7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clstn3Q99JH7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clstn3Q99JH7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clstn3Q99JH7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clstn3Q99JH7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Clstn3Q99JH7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clstn3Q99JH7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clstn3Q99JH7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clstn3Q99JH7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clstn3Q99JH7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Clstn3Q99JH7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clstn3Q99JH7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clstn3Q99JH7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clstn3Q99JH7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clstn3Q99JH7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clstn3Q99JH7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clstn3Q99JH7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clstn3Q99JH7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Clstn3Q99JH7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Clstn3Q99JH7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Clstn3Q99JH7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Clstn3Q99JH7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Clstn3Q99JH7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clstn3Q99JH7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clstn3Q99JH7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clstn3Q99JH7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clstn3Q99JH7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clstn3Q99JH7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clstn3Q99JH7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clstn3Q99JH7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clstn3Q99JH7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clstn3Q99JH7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clstn3Q99JH7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clstn3Q99JH7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clstn3Q99JH7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clstn3Q99JH7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clstn3Q99JH7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clstn3Q99JH7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clstn3Q99JH7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clstn3Q99JH7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clstn3Q99JH7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clstn3Q99JH7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms