Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Apobec3Q99J72 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Apobec3Q99J72 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Apobec3Q99J72 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Apobec3Q99J72 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Apobec3Q99J72 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Apobec3Q99J72 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Apobec3Q99J72 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Apobec3Q99J72 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Apobec3Q99J72 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Apobec3Q99J72 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Apobec3Q99J72 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Apobec3Q99J72 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Apobec3Q99J72 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Apobec3Q99J72 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Apobec3Q99J72 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Apobec3Q99J72 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Apobec3Q99J72 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Apobec3Q99J72 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Apobec3Q99J72 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Apobec3Q99J72 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Apobec3Q99J72 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Apobec3Q99J72 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Apobec3Q99J72 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Apobec3Q99J72 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Apobec3Q99J72 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Apobec3Q99J72 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Apobec3Q99J72 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Apobec3Q99J72 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Apobec3Q99J72 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Apobec3Q99J72 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Apobec3Q99J72 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Apobec3Q99J72 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Apobec3Q99J72 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Apobec3Q99J72 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Apobec3Q99J72 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Apobec3Q99J72 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Apobec3Q99J72 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Apobec3Q99J72 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Apobec3Q99J72 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Apobec3Q99J72 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Apobec3Q99J72 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Apobec3Q99J72 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Apobec3Q99J72 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Apobec3Q99J72 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Apobec3Q99J72 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Apobec3Q99J72 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Apobec3Q99J72 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Apobec3Q99J72 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Apobec3Q99J72 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Apobec3Q99J72 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Apobec3Q99J72 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Apobec3Q99J72 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Apobec3Q99J72 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Apobec3Q99J72 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Apobec3Q99J72 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Apobec3Q99J72 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Apobec3Q99J72 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Apobec3Q99J72 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Apobec3Q99J72 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Apobec3Q99J72 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Apobec3Q99J72 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Apobec3Q99J72 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Apobec3Q99J72 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Apobec3Q99J72 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Apobec3Q99J72 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Apobec3Q99J72 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Apobec3Q99J72 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Apobec3Q99J72 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Apobec3Q99J72 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Apobec3Q99J72 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Apobec3Q99J72 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Apobec3Q99J72 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Apobec3Q99J72 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Apobec3Q99J72 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Apobec3Q99J72 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Apobec3Q99J72 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Apobec3Q99J72 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Apobec3Q99J72 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Apobec3Q99J72 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Apobec3Q99J72 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Apobec3Q99J72 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Apobec3Q99J72 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Apobec3Q99J72 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Apobec3Q99J72 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Apobec3Q99J72 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Apobec3Q99J72 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Apobec3Q99J72 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Apobec3Q99J72 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Apobec3Q99J72 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Apobec3Q99J72 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Apobec3Q99J72 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Apobec3Q99J72 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Apobec3Q99J72 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Apobec3Q99J72 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Apobec3Q99J72 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Apobec3Q99J72 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Apobec3Q99J72 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Apobec3Q99J72 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Apobec3Q99J72 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms