Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smim11aQ99J19 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smim11aQ99J19 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smim11aQ99J19 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smim11aQ99J19 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smim11aQ99J19 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smim11aQ99J19 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smim11aQ99J19 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smim11aQ99J19 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smim11aQ99J19 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smim11aQ99J19 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smim11aQ99J19 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smim11aQ99J19 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smim11aQ99J19 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smim11aQ99J19 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smim11aQ99J19 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Smim11aQ99J19 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Smim11aQ99J19 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smim11aQ99J19 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smim11aQ99J19 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smim11aQ99J19 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smim11aQ99J19 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smim11aQ99J19 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smim11aQ99J19 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smim11aQ99J19 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smim11aQ99J19 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smim11aQ99J19 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smim11aQ99J19 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smim11aQ99J19 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smim11aQ99J19 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smim11aQ99J19 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20■□□□□ 0.79
Smim11aQ99J19 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smim11aQ99J19 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smim11aQ99J19 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Smim11aQ99J19 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smim11aQ99J19 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smim11aQ99J19 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smim11aQ99J19 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smim11aQ99J19 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smim11aQ99J19 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smim11aQ99J19 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smim11aQ99J19 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smim11aQ99J19 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smim11aQ99J19 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smim11aQ99J19 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smim11aQ99J19 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smim11aQ99J19 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smim11aQ99J19 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smim11aQ99J19 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smim11aQ99J19 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smim11aQ99J19 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smim11aQ99J19 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Smim11aQ99J19 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smim11aQ99J19 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smim11aQ99J19 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smim11aQ99J19 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smim11aQ99J19 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smim11aQ99J19 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smim11aQ99J19 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smim11aQ99J19 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smim11aQ99J19 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Smim11aQ99J19 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smim11aQ99J19 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smim11aQ99J19 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smim11aQ99J19 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smim11aQ99J19 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smim11aQ99J19 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smim11aQ99J19 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smim11aQ99J19 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smim11aQ99J19 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smim11aQ99J19 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smim11aQ99J19 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smim11aQ99J19 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smim11aQ99J19 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smim11aQ99J19 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smim11aQ99J19 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Smim11aQ99J19 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smim11aQ99J19 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smim11aQ99J19 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smim11aQ99J19 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smim11aQ99J19 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smim11aQ99J19 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smim11aQ99J19 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smim11aQ99J19 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smim11aQ99J19 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smim11aQ99J19 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smim11aQ99J19 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smim11aQ99J19 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smim11aQ99J19 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smim11aQ99J19 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smim11aQ99J19 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smim11aQ99J19 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Smim11aQ99J19 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smim11aQ99J19 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smim11aQ99J19 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smim11aQ99J19 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smim11aQ99J19 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smim11aQ99J19 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smim11aQ99J19 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smim11aQ99J19 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
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