Protein–RNA interactions for Protein: Q925I7

Pdgfd, Platelet-derived growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfdQ925I7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PdgfdQ925I7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PdgfdQ925I7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PdgfdQ925I7 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PdgfdQ925I7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PdgfdQ925I7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PdgfdQ925I7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PdgfdQ925I7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PdgfdQ925I7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PdgfdQ925I7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PdgfdQ925I7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PdgfdQ925I7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PdgfdQ925I7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PdgfdQ925I7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PdgfdQ925I7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PdgfdQ925I7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PdgfdQ925I7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PdgfdQ925I7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PdgfdQ925I7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PdgfdQ925I7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PdgfdQ925I7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PdgfdQ925I7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PdgfdQ925I7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PdgfdQ925I7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PdgfdQ925I7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PdgfdQ925I7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PdgfdQ925I7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PdgfdQ925I7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PdgfdQ925I7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PdgfdQ925I7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PdgfdQ925I7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PdgfdQ925I7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PdgfdQ925I7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PdgfdQ925I7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PdgfdQ925I7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PdgfdQ925I7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PdgfdQ925I7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PdgfdQ925I7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PdgfdQ925I7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PdgfdQ925I7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PdgfdQ925I7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PdgfdQ925I7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PdgfdQ925I7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PdgfdQ925I7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PdgfdQ925I7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PdgfdQ925I7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PdgfdQ925I7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PdgfdQ925I7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PdgfdQ925I7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PdgfdQ925I7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PdgfdQ925I7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PdgfdQ925I7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PdgfdQ925I7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PdgfdQ925I7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PdgfdQ925I7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PdgfdQ925I7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PdgfdQ925I7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PdgfdQ925I7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PdgfdQ925I7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PdgfdQ925I7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PdgfdQ925I7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PdgfdQ925I7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PdgfdQ925I7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PdgfdQ925I7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PdgfdQ925I7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PdgfdQ925I7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PdgfdQ925I7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PdgfdQ925I7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PdgfdQ925I7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PdgfdQ925I7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PdgfdQ925I7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PdgfdQ925I7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PdgfdQ925I7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PdgfdQ925I7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PdgfdQ925I7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PdgfdQ925I7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PdgfdQ925I7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PdgfdQ925I7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PdgfdQ925I7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PdgfdQ925I7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PdgfdQ925I7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PdgfdQ925I7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PdgfdQ925I7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PdgfdQ925I7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PdgfdQ925I7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PdgfdQ925I7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PdgfdQ925I7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PdgfdQ925I7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PdgfdQ925I7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PdgfdQ925I7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PdgfdQ925I7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PdgfdQ925I7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PdgfdQ925I7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PdgfdQ925I7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PdgfdQ925I7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PdgfdQ925I7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PdgfdQ925I7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PdgfdQ925I7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PdgfdQ925I7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PdgfdQ925I7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms