Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim7Q923T7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim7Q923T7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim7Q923T7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim7Q923T7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim7Q923T7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim7Q923T7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim7Q923T7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim7Q923T7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim7Q923T7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim7Q923T7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim7Q923T7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim7Q923T7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim7Q923T7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim7Q923T7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim7Q923T7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim7Q923T7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim7Q923T7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim7Q923T7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim7Q923T7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim7Q923T7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim7Q923T7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim7Q923T7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim7Q923T7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim7Q923T7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim7Q923T7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim7Q923T7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim7Q923T7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim7Q923T7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim7Q923T7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim7Q923T7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim7Q923T7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim7Q923T7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim7Q923T7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Trim7Q923T7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Trim7Q923T7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim7Q923T7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim7Q923T7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim7Q923T7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim7Q923T7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim7Q923T7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim7Q923T7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim7Q923T7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trim7Q923T7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trim7Q923T7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trim7Q923T7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trim7Q923T7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trim7Q923T7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim7Q923T7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim7Q923T7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim7Q923T7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim7Q923T7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim7Q923T7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim7Q923T7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim7Q923T7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim7Q923T7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim7Q923T7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim7Q923T7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim7Q923T7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim7Q923T7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim7Q923T7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim7Q923T7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim7Q923T7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim7Q923T7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim7Q923T7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim7Q923T7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim7Q923T7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim7Q923T7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim7Q923T7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim7Q923T7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim7Q923T7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim7Q923T7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim7Q923T7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim7Q923T7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim7Q923T7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim7Q923T7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim7Q923T7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim7Q923T7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim7Q923T7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim7Q923T7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim7Q923T7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim7Q923T7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim7Q923T7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim7Q923T7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim7Q923T7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim7Q923T7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim7Q923T7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim7Q923T7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim7Q923T7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim7Q923T7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim7Q923T7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim7Q923T7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim7Q923T7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim7Q923T7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim7Q923T7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim7Q923T7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim7Q923T7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim7Q923T7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim7Q923T7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim7Q923T7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms