Protein–RNA interactions for Protein: Q923D4

Sf3b5, Splicing factor 3B subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b5Q923D4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sf3b5Q923D4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sf3b5Q923D4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sf3b5Q923D4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3b5Q923D4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3b5Q923D4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3b5Q923D4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3b5Q923D4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3b5Q923D4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3b5Q923D4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3b5Q923D4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3b5Q923D4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3b5Q923D4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3b5Q923D4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf3b5Q923D4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf3b5Q923D4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf3b5Q923D4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf3b5Q923D4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf3b5Q923D4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf3b5Q923D4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3b5Q923D4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3b5Q923D4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3b5Q923D4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3b5Q923D4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3b5Q923D4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3b5Q923D4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3b5Q923D4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3b5Q923D4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3b5Q923D4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3b5Q923D4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3b5Q923D4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3b5Q923D4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3b5Q923D4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3b5Q923D4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3b5Q923D4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3b5Q923D4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3b5Q923D4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3b5Q923D4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3b5Q923D4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3b5Q923D4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3b5Q923D4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3b5Q923D4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3b5Q923D4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3b5Q923D4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3b5Q923D4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3b5Q923D4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3b5Q923D4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3b5Q923D4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3b5Q923D4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3b5Q923D4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3b5Q923D4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sf3b5Q923D4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sf3b5Q923D4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sf3b5Q923D4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sf3b5Q923D4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sf3b5Q923D4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sf3b5Q923D4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sf3b5Q923D4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sf3b5Q923D4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sf3b5Q923D4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3b5Q923D4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3b5Q923D4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3b5Q923D4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3b5Q923D4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3b5Q923D4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3b5Q923D4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3b5Q923D4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3b5Q923D4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Sf3b5Q923D4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Sf3b5Q923D4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sf3b5Q923D4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sf3b5Q923D4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sf3b5Q923D4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sf3b5Q923D4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sf3b5Q923D4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sf3b5Q923D4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sf3b5Q923D4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sf3b5Q923D4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sf3b5Q923D4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sf3b5Q923D4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sf3b5Q923D4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3b5Q923D4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3b5Q923D4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3b5Q923D4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3b5Q923D4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3b5Q923D4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3b5Q923D4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3b5Q923D4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3b5Q923D4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3b5Q923D4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3b5Q923D4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b5Q923D4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b5Q923D4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b5Q923D4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b5Q923D4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b5Q923D4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b5Q923D4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b5Q923D4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b5Q923D4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b5Q923D4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.7 ms