Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nrif1Q923B3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nrif1Q923B3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nrif1Q923B3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nrif1Q923B3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Nrif1Q923B3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nrif1Q923B3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nrif1Q923B3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nrif1Q923B3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nrif1Q923B3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nrif1Q923B3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nrif1Q923B3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Nrif1Q923B3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nrif1Q923B3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nrif1Q923B3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nrif1Q923B3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nrif1Q923B3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nrif1Q923B3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Nrif1Q923B3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nrif1Q923B3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nrif1Q923B3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nrif1Q923B3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nrif1Q923B3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nrif1Q923B3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nrif1Q923B3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nrif1Q923B3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nrif1Q923B3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nrif1Q923B3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nrif1Q923B3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nrif1Q923B3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nrif1Q923B3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nrif1Q923B3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nrif1Q923B3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nrif1Q923B3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nrif1Q923B3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nrif1Q923B3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nrif1Q923B3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nrif1Q923B3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nrif1Q923B3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nrif1Q923B3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nrif1Q923B3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nrif1Q923B3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nrif1Q923B3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nrif1Q923B3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nrif1Q923B3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nrif1Q923B3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nrif1Q923B3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nrif1Q923B3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nrif1Q923B3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nrif1Q923B3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nrif1Q923B3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nrif1Q923B3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nrif1Q923B3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nrif1Q923B3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nrif1Q923B3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nrif1Q923B3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nrif1Q923B3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nrif1Q923B3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nrif1Q923B3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nrif1Q923B3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nrif1Q923B3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nrif1Q923B3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nrif1Q923B3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nrif1Q923B3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nrif1Q923B3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nrif1Q923B3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nrif1Q923B3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nrif1Q923B3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nrif1Q923B3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nrif1Q923B3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nrif1Q923B3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nrif1Q923B3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nrif1Q923B3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nrif1Q923B3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nrif1Q923B3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Nrif1Q923B3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nrif1Q923B3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nrif1Q923B3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nrif1Q923B3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nrif1Q923B3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nrif1Q923B3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nrif1Q923B3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nrif1Q923B3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nrif1Q923B3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nrif1Q923B3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Nrif1Q923B3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nrif1Q923B3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nrif1Q923B3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nrif1Q923B3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Nrif1Q923B3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nrif1Q923B3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nrif1Q923B3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nrif1Q923B3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nrif1Q923B3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nrif1Q923B3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nrif1Q923B3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nrif1Q923B3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Nrif1Q923B3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nrif1Q923B3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nrif1Q923B3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms