Protein–RNA interactions for Protein: Q922I5

Foxi1, Forkhead box protein I1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxi1Q922I5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxi1Q922I5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxi1Q922I5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxi1Q922I5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxi1Q922I5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxi1Q922I5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxi1Q922I5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxi1Q922I5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxi1Q922I5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxi1Q922I5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxi1Q922I5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxi1Q922I5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxi1Q922I5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxi1Q922I5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxi1Q922I5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxi1Q922I5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxi1Q922I5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxi1Q922I5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxi1Q922I5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxi1Q922I5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxi1Q922I5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxi1Q922I5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxi1Q922I5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxi1Q922I5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxi1Q922I5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxi1Q922I5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxi1Q922I5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxi1Q922I5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxi1Q922I5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxi1Q922I5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxi1Q922I5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxi1Q922I5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxi1Q922I5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxi1Q922I5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxi1Q922I5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxi1Q922I5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxi1Q922I5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxi1Q922I5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxi1Q922I5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxi1Q922I5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxi1Q922I5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxi1Q922I5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxi1Q922I5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxi1Q922I5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxi1Q922I5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxi1Q922I5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxi1Q922I5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxi1Q922I5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxi1Q922I5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxi1Q922I5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxi1Q922I5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxi1Q922I5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxi1Q922I5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxi1Q922I5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxi1Q922I5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxi1Q922I5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Foxi1Q922I5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Foxi1Q922I5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxi1Q922I5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Foxi1Q922I5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxi1Q922I5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Foxi1Q922I5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Foxi1Q922I5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxi1Q922I5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxi1Q922I5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxi1Q922I5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxi1Q922I5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxi1Q922I5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Foxi1Q922I5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Foxi1Q922I5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxi1Q922I5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxi1Q922I5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Foxi1Q922I5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxi1Q922I5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxi1Q922I5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxi1Q922I5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Foxi1Q922I5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Foxi1Q922I5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Foxi1Q922I5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Foxi1Q922I5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Foxi1Q922I5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Foxi1Q922I5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Foxi1Q922I5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxi1Q922I5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxi1Q922I5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Foxi1Q922I5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Foxi1Q922I5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxi1Q922I5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Foxi1Q922I5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxi1Q922I5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Foxi1Q922I5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxi1Q922I5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxi1Q922I5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxi1Q922I5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxi1Q922I5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxi1Q922I5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Foxi1Q922I5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxi1Q922I5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxi1Q922I5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxi1Q922I5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms