Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZP4

Slc5a4b, MCG3105, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a4bQ91ZP4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Slc5a4bQ91ZP4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Slc5a4bQ91ZP4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Slc5a4bQ91ZP4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Slc5a4bQ91ZP4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Slc5a4bQ91ZP4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Slc5a4bQ91ZP4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Slc5a4bQ91ZP4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Slc5a4bQ91ZP4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Slc5a4bQ91ZP4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Slc5a4bQ91ZP4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Slc5a4bQ91ZP4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Slc5a4bQ91ZP4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Slc5a4bQ91ZP4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Slc5a4bQ91ZP4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Slc5a4bQ91ZP4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Slc5a4bQ91ZP4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Slc5a4bQ91ZP4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Slc5a4bQ91ZP4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Slc5a4bQ91ZP4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Slc5a4bQ91ZP4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Slc5a4bQ91ZP4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Slc5a4bQ91ZP4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Slc5a4bQ91ZP4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Slc5a4bQ91ZP4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Slc5a4bQ91ZP4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Slc5a4bQ91ZP4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Slc5a4bQ91ZP4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Slc5a4bQ91ZP4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Slc5a4bQ91ZP4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Slc5a4bQ91ZP4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Slc5a4bQ91ZP4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Slc5a4bQ91ZP4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Slc5a4bQ91ZP4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Slc5a4bQ91ZP4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Slc5a4bQ91ZP4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Slc5a4bQ91ZP4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Slc5a4bQ91ZP4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Slc5a4bQ91ZP4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Slc5a4bQ91ZP4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Slc5a4bQ91ZP4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Slc5a4bQ91ZP4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Slc5a4bQ91ZP4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Slc5a4bQ91ZP4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Slc5a4bQ91ZP4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Slc5a4bQ91ZP4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Slc5a4bQ91ZP4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Slc5a4bQ91ZP4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Slc5a4bQ91ZP4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Slc5a4bQ91ZP4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Slc5a4bQ91ZP4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Slc5a4bQ91ZP4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Slc5a4bQ91ZP4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Slc5a4bQ91ZP4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Slc5a4bQ91ZP4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Slc5a4bQ91ZP4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Slc5a4bQ91ZP4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Slc5a4bQ91ZP4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Slc5a4bQ91ZP4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Slc5a4bQ91ZP4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Slc5a4bQ91ZP4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Slc5a4bQ91ZP4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Slc5a4bQ91ZP4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Slc5a4bQ91ZP4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Slc5a4bQ91ZP4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Slc5a4bQ91ZP4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Slc5a4bQ91ZP4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Slc5a4bQ91ZP4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Slc5a4bQ91ZP4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Slc5a4bQ91ZP4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Slc5a4bQ91ZP4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Slc5a4bQ91ZP4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Slc5a4bQ91ZP4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Slc5a4bQ91ZP4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Slc5a4bQ91ZP4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Slc5a4bQ91ZP4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Slc5a4bQ91ZP4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Slc5a4bQ91ZP4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Slc5a4bQ91ZP4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Slc5a4bQ91ZP4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Slc5a4bQ91ZP4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Slc5a4bQ91ZP4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Slc5a4bQ91ZP4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Slc5a4bQ91ZP4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Slc5a4bQ91ZP4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Slc5a4bQ91ZP4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Slc5a4bQ91ZP4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Slc5a4bQ91ZP4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Slc5a4bQ91ZP4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Slc5a4bQ91ZP4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Slc5a4bQ91ZP4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Slc5a4bQ91ZP4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Slc5a4bQ91ZP4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Slc5a4bQ91ZP4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Slc5a4bQ91ZP4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Slc5a4bQ91ZP4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Slc5a4bQ91ZP4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Slc5a4bQ91ZP4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Slc5a4bQ91ZP4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Slc5a4bQ91ZP4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms