Protein–RNA interactions for Protein: Q91WD4

UPF0415 protein C7orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q91WD4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Q91WD4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Q91WD4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q91WD4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q91WD4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q91WD4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Q91WD4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q91WD4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q91WD4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q91WD4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q91WD4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q91WD4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q91WD4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q91WD4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q91WD4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q91WD4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q91WD4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q91WD4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q91WD4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q91WD4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q91WD4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q91WD4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q91WD4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q91WD4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q91WD4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q91WD4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q91WD4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q91WD4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q91WD4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q91WD4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q91WD4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q91WD4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q91WD4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q91WD4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Q91WD4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q91WD4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q91WD4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q91WD4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q91WD4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q91WD4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q91WD4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q91WD4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q91WD4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q91WD4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q91WD4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q91WD4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q91WD4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q91WD4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q91WD4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Q91WD4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q91WD4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q91WD4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q91WD4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q91WD4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q91WD4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Q91WD4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q91WD4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q91WD4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q91WD4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q91WD4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q91WD4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q91WD4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q91WD4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q91WD4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q91WD4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q91WD4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Q91WD4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Q91WD4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q91WD4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q91WD4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q91WD4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q91WD4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q91WD4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q91WD4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q91WD4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q91WD4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q91WD4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q91WD4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q91WD4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q91WD4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q91WD4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Q91WD4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q91WD4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q91WD4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q91WD4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q91WD4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Q91WD4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q91WD4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q91WD4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q91WD4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q91WD4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q91WD4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q91WD4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q91WD4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q91WD4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Q91WD4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q91WD4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Q91WD4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q91WD4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q91WD4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 176.1 ms