Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp3Q91W36 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp3Q91W36 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp3Q91W36 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp3Q91W36 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp3Q91W36 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp3Q91W36 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp3Q91W36 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp3Q91W36 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp3Q91W36 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp3Q91W36 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp3Q91W36 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp3Q91W36 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp3Q91W36 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp3Q91W36 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp3Q91W36 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp3Q91W36 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp3Q91W36 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp3Q91W36 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp3Q91W36 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp3Q91W36 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp3Q91W36 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp3Q91W36 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp3Q91W36 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp3Q91W36 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp3Q91W36 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp3Q91W36 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp3Q91W36 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp3Q91W36 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp3Q91W36 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp3Q91W36 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp3Q91W36 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp3Q91W36 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp3Q91W36 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp3Q91W36 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp3Q91W36 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp3Q91W36 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp3Q91W36 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp3Q91W36 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp3Q91W36 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp3Q91W36 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp3Q91W36 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp3Q91W36 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp3Q91W36 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp3Q91W36 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp3Q91W36 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp3Q91W36 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp3Q91W36 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp3Q91W36 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp3Q91W36 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp3Q91W36 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp3Q91W36 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp3Q91W36 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp3Q91W36 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Usp3Q91W36 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Usp3Q91W36 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Usp3Q91W36 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp3Q91W36 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp3Q91W36 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp3Q91W36 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp3Q91W36 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp3Q91W36 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp3Q91W36 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp3Q91W36 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp3Q91W36 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp3Q91W36 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp3Q91W36 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp3Q91W36 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp3Q91W36 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp3Q91W36 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp3Q91W36 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp3Q91W36 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp3Q91W36 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp3Q91W36 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp3Q91W36 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp3Q91W36 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp3Q91W36 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp3Q91W36 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp3Q91W36 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp3Q91W36 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp3Q91W36 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp3Q91W36 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp3Q91W36 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp3Q91W36 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp3Q91W36 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp3Q91W36 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp3Q91W36 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp3Q91W36 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp3Q91W36 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp3Q91W36 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp3Q91W36 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp3Q91W36 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp3Q91W36 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp3Q91W36 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp3Q91W36 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp3Q91W36 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp3Q91W36 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp3Q91W36 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp3Q91W36 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp3Q91W36 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms