Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW9

Zkscan3, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 3, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan3Q91VW9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zkscan3Q91VW9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zkscan3Q91VW9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zkscan3Q91VW9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zkscan3Q91VW9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zkscan3Q91VW9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zkscan3Q91VW9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zkscan3Q91VW9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zkscan3Q91VW9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zkscan3Q91VW9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zkscan3Q91VW9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zkscan3Q91VW9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zkscan3Q91VW9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zkscan3Q91VW9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zkscan3Q91VW9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zkscan3Q91VW9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zkscan3Q91VW9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zkscan3Q91VW9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zkscan3Q91VW9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zkscan3Q91VW9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zkscan3Q91VW9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zkscan3Q91VW9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zkscan3Q91VW9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Zkscan3Q91VW9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Zkscan3Q91VW9 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zkscan3Q91VW9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zkscan3Q91VW9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zkscan3Q91VW9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zkscan3Q91VW9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zkscan3Q91VW9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zkscan3Q91VW9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zkscan3Q91VW9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zkscan3Q91VW9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zkscan3Q91VW9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zkscan3Q91VW9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Zkscan3Q91VW9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zkscan3Q91VW9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zkscan3Q91VW9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zkscan3Q91VW9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zkscan3Q91VW9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zkscan3Q91VW9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zkscan3Q91VW9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zkscan3Q91VW9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zkscan3Q91VW9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zkscan3Q91VW9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zkscan3Q91VW9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zkscan3Q91VW9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zkscan3Q91VW9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zkscan3Q91VW9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zkscan3Q91VW9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zkscan3Q91VW9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zkscan3Q91VW9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zkscan3Q91VW9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zkscan3Q91VW9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zkscan3Q91VW9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zkscan3Q91VW9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zkscan3Q91VW9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zkscan3Q91VW9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zkscan3Q91VW9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zkscan3Q91VW9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zkscan3Q91VW9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zkscan3Q91VW9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Zkscan3Q91VW9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zkscan3Q91VW9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zkscan3Q91VW9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zkscan3Q91VW9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zkscan3Q91VW9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zkscan3Q91VW9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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Zkscan3Q91VW9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zkscan3Q91VW9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zkscan3Q91VW9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zkscan3Q91VW9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zkscan3Q91VW9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zkscan3Q91VW9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zkscan3Q91VW9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zkscan3Q91VW9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zkscan3Q91VW9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zkscan3Q91VW9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zkscan3Q91VW9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Zkscan3Q91VW9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zkscan3Q91VW9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zkscan3Q91VW9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zkscan3Q91VW9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zkscan3Q91VW9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zkscan3Q91VW9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zkscan3Q91VW9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zkscan3Q91VW9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zkscan3Q91VW9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zkscan3Q91VW9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zkscan3Q91VW9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zkscan3Q91VW9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zkscan3Q91VW9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zkscan3Q91VW9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zkscan3Q91VW9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zkscan3Q91VW9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zkscan3Q91VW9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zkscan3Q91VW9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Zkscan3Q91VW9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zkscan3Q91VW9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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