Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC3

Selenom, Selenoprotein M, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenomQ8VHC3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SelenomQ8VHC3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SelenomQ8VHC3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SelenomQ8VHC3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SelenomQ8VHC3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SelenomQ8VHC3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SelenomQ8VHC3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SelenomQ8VHC3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SelenomQ8VHC3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SelenomQ8VHC3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SelenomQ8VHC3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SelenomQ8VHC3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SelenomQ8VHC3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SelenomQ8VHC3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SelenomQ8VHC3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SelenomQ8VHC3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SelenomQ8VHC3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SelenomQ8VHC3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SelenomQ8VHC3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SelenomQ8VHC3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SelenomQ8VHC3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SelenomQ8VHC3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SelenomQ8VHC3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SelenomQ8VHC3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SelenomQ8VHC3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SelenomQ8VHC3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SelenomQ8VHC3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SelenomQ8VHC3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SelenomQ8VHC3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SelenomQ8VHC3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SelenomQ8VHC3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SelenomQ8VHC3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SelenomQ8VHC3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SelenomQ8VHC3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SelenomQ8VHC3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SelenomQ8VHC3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SelenomQ8VHC3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SelenomQ8VHC3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SelenomQ8VHC3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SelenomQ8VHC3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SelenomQ8VHC3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SelenomQ8VHC3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SelenomQ8VHC3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SelenomQ8VHC3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SelenomQ8VHC3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SelenomQ8VHC3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SelenomQ8VHC3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SelenomQ8VHC3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SelenomQ8VHC3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SelenomQ8VHC3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SelenomQ8VHC3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SelenomQ8VHC3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SelenomQ8VHC3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SelenomQ8VHC3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SelenomQ8VHC3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SelenomQ8VHC3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SelenomQ8VHC3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SelenomQ8VHC3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SelenomQ8VHC3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SelenomQ8VHC3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SelenomQ8VHC3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SelenomQ8VHC3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SelenomQ8VHC3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SelenomQ8VHC3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SelenomQ8VHC3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SelenomQ8VHC3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SelenomQ8VHC3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SelenomQ8VHC3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SelenomQ8VHC3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SelenomQ8VHC3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SelenomQ8VHC3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SelenomQ8VHC3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SelenomQ8VHC3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SelenomQ8VHC3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SelenomQ8VHC3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SelenomQ8VHC3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SelenomQ8VHC3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SelenomQ8VHC3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SelenomQ8VHC3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SelenomQ8VHC3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SelenomQ8VHC3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SelenomQ8VHC3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SelenomQ8VHC3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SelenomQ8VHC3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SelenomQ8VHC3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SelenomQ8VHC3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SelenomQ8VHC3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SelenomQ8VHC3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SelenomQ8VHC3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SelenomQ8VHC3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SelenomQ8VHC3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SelenomQ8VHC3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SelenomQ8VHC3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SelenomQ8VHC3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SelenomQ8VHC3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SelenomQ8VHC3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SelenomQ8VHC3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SelenomQ8VHC3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SelenomQ8VHC3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SelenomQ8VHC3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms