Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Cul7Q8VE73 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Cul7Q8VE73 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Cul7Q8VE73 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Cul7Q8VE73 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Cul7Q8VE73 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Cul7Q8VE73 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Cul7Q8VE73 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Cul7Q8VE73 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Cul7Q8VE73 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Cul7Q8VE73 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Cul7Q8VE73 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Cul7Q8VE73 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Cul7Q8VE73 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Cul7Q8VE73 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Cul7Q8VE73 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Cul7Q8VE73 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Cul7Q8VE73 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
Cul7Q8VE73 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Cul7Q8VE73 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Cul7Q8VE73 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Cul7Q8VE73 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Cul7Q8VE73 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Cul7Q8VE73 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Cul7Q8VE73 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Cul7Q8VE73 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Cul7Q8VE73 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Cul7Q8VE73 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Cul7Q8VE73 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Cul7Q8VE73 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Cul7Q8VE73 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Cul7Q8VE73 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Cul7Q8VE73 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Cul7Q8VE73 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Cul7Q8VE73 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Cul7Q8VE73 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Cul7Q8VE73 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Cul7Q8VE73 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Cul7Q8VE73 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Cul7Q8VE73 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Cul7Q8VE73 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Cul7Q8VE73 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Cul7Q8VE73 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Cul7Q8VE73 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Cul7Q8VE73 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Cul7Q8VE73 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Cul7Q8VE73 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Cul7Q8VE73 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Cul7Q8VE73 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Cul7Q8VE73 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
Cul7Q8VE73 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Cul7Q8VE73 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Cul7Q8VE73 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Cul7Q8VE73 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Cul7Q8VE73 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Cul7Q8VE73 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Cul7Q8VE73 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Cul7Q8VE73 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Cul7Q8VE73 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Cul7Q8VE73 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Cul7Q8VE73 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Cul7Q8VE73 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Cul7Q8VE73 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
Cul7Q8VE73 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Cul7Q8VE73 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Cul7Q8VE73 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Cul7Q8VE73 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Cul7Q8VE73 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Cul7Q8VE73 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Cul7Q8VE73 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Cul7Q8VE73 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Cul7Q8VE73 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Cul7Q8VE73 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Cul7Q8VE73 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Cul7Q8VE73 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Cul7Q8VE73 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Cul7Q8VE73 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Cul7Q8VE73 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Cul7Q8VE73 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Cul7Q8VE73 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Cul7Q8VE73 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Cul7Q8VE73 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Cul7Q8VE73 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Cul7Q8VE73 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
Cul7Q8VE73 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
Cul7Q8VE73 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Cul7Q8VE73 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Cul7Q8VE73 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Cul7Q8VE73 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Cul7Q8VE73 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Cul7Q8VE73 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Cul7Q8VE73 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Cul7Q8VE73 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Cul7Q8VE73 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Cul7Q8VE73 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Cul7Q8VE73 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Cul7Q8VE73 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Cul7Q8VE73 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Cul7Q8VE73 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Cul7Q8VE73 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms