Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU3

Apol9a, Apol9a protein, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol9aQ8VDU3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apol9aQ8VDU3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apol9aQ8VDU3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apol9aQ8VDU3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apol9aQ8VDU3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apol9aQ8VDU3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apol9aQ8VDU3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apol9aQ8VDU3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apol9aQ8VDU3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Apol9aQ8VDU3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apol9aQ8VDU3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apol9aQ8VDU3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apol9aQ8VDU3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apol9aQ8VDU3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apol9aQ8VDU3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apol9aQ8VDU3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apol9aQ8VDU3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apol9aQ8VDU3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apol9aQ8VDU3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apol9aQ8VDU3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apol9aQ8VDU3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apol9aQ8VDU3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apol9aQ8VDU3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apol9aQ8VDU3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apol9aQ8VDU3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apol9aQ8VDU3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apol9aQ8VDU3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apol9aQ8VDU3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apol9aQ8VDU3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Apol9aQ8VDU3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apol9aQ8VDU3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apol9aQ8VDU3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apol9aQ8VDU3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apol9aQ8VDU3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apol9aQ8VDU3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apol9aQ8VDU3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apol9aQ8VDU3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Apol9aQ8VDU3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Apol9aQ8VDU3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Apol9aQ8VDU3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Apol9aQ8VDU3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Apol9aQ8VDU3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Apol9aQ8VDU3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Apol9aQ8VDU3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Apol9aQ8VDU3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Apol9aQ8VDU3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Apol9aQ8VDU3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Apol9aQ8VDU3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Apol9aQ8VDU3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Apol9aQ8VDU3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Apol9aQ8VDU3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Apol9aQ8VDU3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Apol9aQ8VDU3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Apol9aQ8VDU3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Apol9aQ8VDU3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Apol9aQ8VDU3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Apol9aQ8VDU3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Apol9aQ8VDU3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Apol9aQ8VDU3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Apol9aQ8VDU3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Apol9aQ8VDU3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Apol9aQ8VDU3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Apol9aQ8VDU3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Apol9aQ8VDU3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Apol9aQ8VDU3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Apol9aQ8VDU3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Apol9aQ8VDU3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Apol9aQ8VDU3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Apol9aQ8VDU3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Apol9aQ8VDU3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Apol9aQ8VDU3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Apol9aQ8VDU3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Apol9aQ8VDU3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Apol9aQ8VDU3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Apol9aQ8VDU3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Apol9aQ8VDU3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apol9aQ8VDU3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apol9aQ8VDU3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apol9aQ8VDU3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apol9aQ8VDU3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Apol9aQ8VDU3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apol9aQ8VDU3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apol9aQ8VDU3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apol9aQ8VDU3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apol9aQ8VDU3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apol9aQ8VDU3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apol9aQ8VDU3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Apol9aQ8VDU3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apol9aQ8VDU3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apol9aQ8VDU3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Apol9aQ8VDU3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apol9aQ8VDU3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Apol9aQ8VDU3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Apol9aQ8VDU3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Apol9aQ8VDU3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Apol9aQ8VDU3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Apol9aQ8VDU3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Apol9aQ8VDU3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Apol9aQ8VDU3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Apol9aQ8VDU3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms