Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc6a20aQ8VDB9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc6a20aQ8VDB9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc6a20aQ8VDB9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc6a20aQ8VDB9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc6a20aQ8VDB9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc6a20aQ8VDB9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc6a20aQ8VDB9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc6a20aQ8VDB9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc6a20aQ8VDB9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc6a20aQ8VDB9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc6a20aQ8VDB9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc6a20aQ8VDB9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc6a20aQ8VDB9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc6a20aQ8VDB9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc6a20aQ8VDB9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc6a20aQ8VDB9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc6a20aQ8VDB9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc6a20aQ8VDB9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc6a20aQ8VDB9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc6a20aQ8VDB9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc6a20aQ8VDB9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc6a20aQ8VDB9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc6a20aQ8VDB9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc6a20aQ8VDB9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc6a20aQ8VDB9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc6a20aQ8VDB9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc6a20aQ8VDB9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc6a20aQ8VDB9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc6a20aQ8VDB9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc6a20aQ8VDB9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc6a20aQ8VDB9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc6a20aQ8VDB9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc6a20aQ8VDB9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc6a20aQ8VDB9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc6a20aQ8VDB9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc6a20aQ8VDB9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc6a20aQ8VDB9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc6a20aQ8VDB9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc6a20aQ8VDB9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc6a20aQ8VDB9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc6a20aQ8VDB9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc6a20aQ8VDB9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc6a20aQ8VDB9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc6a20aQ8VDB9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc6a20aQ8VDB9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc6a20aQ8VDB9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc6a20aQ8VDB9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc6a20aQ8VDB9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc6a20aQ8VDB9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc6a20aQ8VDB9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc6a20aQ8VDB9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc6a20aQ8VDB9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc6a20aQ8VDB9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc6a20aQ8VDB9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc6a20aQ8VDB9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc6a20aQ8VDB9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc6a20aQ8VDB9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc6a20aQ8VDB9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc6a20aQ8VDB9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc6a20aQ8VDB9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc6a20aQ8VDB9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc6a20aQ8VDB9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc6a20aQ8VDB9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc6a20aQ8VDB9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc6a20aQ8VDB9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc6a20aQ8VDB9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc6a20aQ8VDB9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc6a20aQ8VDB9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc6a20aQ8VDB9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc6a20aQ8VDB9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc6a20aQ8VDB9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc6a20aQ8VDB9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc6a20aQ8VDB9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc6a20aQ8VDB9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc6a20aQ8VDB9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc6a20aQ8VDB9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc6a20aQ8VDB9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc6a20aQ8VDB9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc6a20aQ8VDB9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc6a20aQ8VDB9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc6a20aQ8VDB9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc6a20aQ8VDB9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc6a20aQ8VDB9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc6a20aQ8VDB9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc6a20aQ8VDB9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc6a20aQ8VDB9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc6a20aQ8VDB9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc6a20aQ8VDB9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc6a20aQ8VDB9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc6a20aQ8VDB9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc6a20aQ8VDB9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc6a20aQ8VDB9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc6a20aQ8VDB9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc6a20aQ8VDB9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc6a20aQ8VDB9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc6a20aQ8VDB9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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