Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCW2

Krt25, Keratin, type I cytoskeletal 25, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt25Q8VCW2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Krt25Q8VCW2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Krt25Q8VCW2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Krt25Q8VCW2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Krt25Q8VCW2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Krt25Q8VCW2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Krt25Q8VCW2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Krt25Q8VCW2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Krt25Q8VCW2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Krt25Q8VCW2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Krt25Q8VCW2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Krt25Q8VCW2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Krt25Q8VCW2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Krt25Q8VCW2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Krt25Q8VCW2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Krt25Q8VCW2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Krt25Q8VCW2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Krt25Q8VCW2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Krt25Q8VCW2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Krt25Q8VCW2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Krt25Q8VCW2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Krt25Q8VCW2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Krt25Q8VCW2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Krt25Q8VCW2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Krt25Q8VCW2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Krt25Q8VCW2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Krt25Q8VCW2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Krt25Q8VCW2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Krt25Q8VCW2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Krt25Q8VCW2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Krt25Q8VCW2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Krt25Q8VCW2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Krt25Q8VCW2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Krt25Q8VCW2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Krt25Q8VCW2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Krt25Q8VCW2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Krt25Q8VCW2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Krt25Q8VCW2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Krt25Q8VCW2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Krt25Q8VCW2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Krt25Q8VCW2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Krt25Q8VCW2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Krt25Q8VCW2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Krt25Q8VCW2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Krt25Q8VCW2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krt25Q8VCW2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krt25Q8VCW2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krt25Q8VCW2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krt25Q8VCW2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krt25Q8VCW2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krt25Q8VCW2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krt25Q8VCW2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krt25Q8VCW2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krt25Q8VCW2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Krt25Q8VCW2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Krt25Q8VCW2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Krt25Q8VCW2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Krt25Q8VCW2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Krt25Q8VCW2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Krt25Q8VCW2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Krt25Q8VCW2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Krt25Q8VCW2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Krt25Q8VCW2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Krt25Q8VCW2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Krt25Q8VCW2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Krt25Q8VCW2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Krt25Q8VCW2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Krt25Q8VCW2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Krt25Q8VCW2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Krt25Q8VCW2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Krt25Q8VCW2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Krt25Q8VCW2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Krt25Q8VCW2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Krt25Q8VCW2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Krt25Q8VCW2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Krt25Q8VCW2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Krt25Q8VCW2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Krt25Q8VCW2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Krt25Q8VCW2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Krt25Q8VCW2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Krt25Q8VCW2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Krt25Q8VCW2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Krt25Q8VCW2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Krt25Q8VCW2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Krt25Q8VCW2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Krt25Q8VCW2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Krt25Q8VCW2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Krt25Q8VCW2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Krt25Q8VCW2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Krt25Q8VCW2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt25Q8VCW2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt25Q8VCW2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt25Q8VCW2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt25Q8VCW2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt25Q8VCW2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt25Q8VCW2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt25Q8VCW2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt25Q8VCW2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt25Q8VCW2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt25Q8VCW2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms