Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCQ6

Sgms1, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 1, mousemouse

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Length 419 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgms1Q8VCQ6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sgms1Q8VCQ6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sgms1Q8VCQ6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sgms1Q8VCQ6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sgms1Q8VCQ6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sgms1Q8VCQ6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sgms1Q8VCQ6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sgms1Q8VCQ6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sgms1Q8VCQ6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sgms1Q8VCQ6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sgms1Q8VCQ6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sgms1Q8VCQ6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sgms1Q8VCQ6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sgms1Q8VCQ6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sgms1Q8VCQ6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sgms1Q8VCQ6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sgms1Q8VCQ6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sgms1Q8VCQ6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sgms1Q8VCQ6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sgms1Q8VCQ6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sgms1Q8VCQ6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sgms1Q8VCQ6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sgms1Q8VCQ6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sgms1Q8VCQ6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sgms1Q8VCQ6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sgms1Q8VCQ6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sgms1Q8VCQ6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sgms1Q8VCQ6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sgms1Q8VCQ6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sgms1Q8VCQ6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sgms1Q8VCQ6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Sgms1Q8VCQ6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sgms1Q8VCQ6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sgms1Q8VCQ6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sgms1Q8VCQ6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sgms1Q8VCQ6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sgms1Q8VCQ6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sgms1Q8VCQ6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sgms1Q8VCQ6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sgms1Q8VCQ6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sgms1Q8VCQ6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sgms1Q8VCQ6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sgms1Q8VCQ6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sgms1Q8VCQ6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sgms1Q8VCQ6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sgms1Q8VCQ6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sgms1Q8VCQ6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sgms1Q8VCQ6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sgms1Q8VCQ6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sgms1Q8VCQ6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sgms1Q8VCQ6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sgms1Q8VCQ6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sgms1Q8VCQ6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sgms1Q8VCQ6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sgms1Q8VCQ6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sgms1Q8VCQ6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Sgms1Q8VCQ6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sgms1Q8VCQ6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Sgms1Q8VCQ6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sgms1Q8VCQ6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sgms1Q8VCQ6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Sgms1Q8VCQ6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sgms1Q8VCQ6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sgms1Q8VCQ6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sgms1Q8VCQ6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sgms1Q8VCQ6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sgms1Q8VCQ6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
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Sgms1Q8VCQ6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sgms1Q8VCQ6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sgms1Q8VCQ6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sgms1Q8VCQ6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sgms1Q8VCQ6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sgms1Q8VCQ6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sgms1Q8VCQ6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sgms1Q8VCQ6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sgms1Q8VCQ6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sgms1Q8VCQ6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sgms1Q8VCQ6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sgms1Q8VCQ6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sgms1Q8VCQ6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sgms1Q8VCQ6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sgms1Q8VCQ6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sgms1Q8VCQ6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sgms1Q8VCQ6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sgms1Q8VCQ6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Sgms1Q8VCQ6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sgms1Q8VCQ6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sgms1Q8VCQ6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sgms1Q8VCQ6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sgms1Q8VCQ6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sgms1Q8VCQ6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sgms1Q8VCQ6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sgms1Q8VCQ6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sgms1Q8VCQ6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sgms1Q8VCQ6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sgms1Q8VCQ6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sgms1Q8VCQ6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sgms1Q8VCQ6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sgms1Q8VCQ6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
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