Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC31

Ccdc9, Coiled-coil domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9Q8VC31 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc9Q8VC31 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc9Q8VC31 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc9Q8VC31 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc9Q8VC31 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc9Q8VC31 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc9Q8VC31 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc9Q8VC31 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc9Q8VC31 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc9Q8VC31 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc9Q8VC31 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc9Q8VC31 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc9Q8VC31 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc9Q8VC31 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc9Q8VC31 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc9Q8VC31 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc9Q8VC31 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc9Q8VC31 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc9Q8VC31 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc9Q8VC31 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc9Q8VC31 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc9Q8VC31 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc9Q8VC31 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc9Q8VC31 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc9Q8VC31 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc9Q8VC31 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc9Q8VC31 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc9Q8VC31 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc9Q8VC31 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc9Q8VC31 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc9Q8VC31 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc9Q8VC31 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc9Q8VC31 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc9Q8VC31 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc9Q8VC31 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc9Q8VC31 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc9Q8VC31 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc9Q8VC31 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc9Q8VC31 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc9Q8VC31 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc9Q8VC31 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc9Q8VC31 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc9Q8VC31 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc9Q8VC31 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc9Q8VC31 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc9Q8VC31 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc9Q8VC31 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc9Q8VC31 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc9Q8VC31 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc9Q8VC31 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc9Q8VC31 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc9Q8VC31 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc9Q8VC31 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc9Q8VC31 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc9Q8VC31 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc9Q8VC31 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc9Q8VC31 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc9Q8VC31 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc9Q8VC31 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc9Q8VC31 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc9Q8VC31 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc9Q8VC31 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc9Q8VC31 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc9Q8VC31 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc9Q8VC31 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc9Q8VC31 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc9Q8VC31 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc9Q8VC31 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc9Q8VC31 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc9Q8VC31 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc9Q8VC31 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc9Q8VC31 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc9Q8VC31 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc9Q8VC31 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc9Q8VC31 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc9Q8VC31 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc9Q8VC31 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc9Q8VC31 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc9Q8VC31 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc9Q8VC31 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc9Q8VC31 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc9Q8VC31 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc9Q8VC31 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc9Q8VC31 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc9Q8VC31 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc9Q8VC31 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc9Q8VC31 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc9Q8VC31 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc9Q8VC31 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc9Q8VC31 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc9Q8VC31 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc9Q8VC31 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc9Q8VC31 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc9Q8VC31 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc9Q8VC31 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc9Q8VC31 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc9Q8VC31 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc9Q8VC31 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc9Q8VC31 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc9Q8VC31 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms