Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2T8

Gtf3c5, General transcription factor 3C polypeptide 5, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c5Q8R2T8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gtf3c5Q8R2T8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gtf3c5Q8R2T8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gtf3c5Q8R2T8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gtf3c5Q8R2T8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gtf3c5Q8R2T8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gtf3c5Q8R2T8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gtf3c5Q8R2T8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gtf3c5Q8R2T8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gtf3c5Q8R2T8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gtf3c5Q8R2T8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gtf3c5Q8R2T8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gtf3c5Q8R2T8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gtf3c5Q8R2T8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gtf3c5Q8R2T8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gtf3c5Q8R2T8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gtf3c5Q8R2T8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gtf3c5Q8R2T8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gtf3c5Q8R2T8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gtf3c5Q8R2T8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gtf3c5Q8R2T8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gtf3c5Q8R2T8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gtf3c5Q8R2T8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gtf3c5Q8R2T8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gtf3c5Q8R2T8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gtf3c5Q8R2T8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gtf3c5Q8R2T8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gtf3c5Q8R2T8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gtf3c5Q8R2T8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gtf3c5Q8R2T8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gtf3c5Q8R2T8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gtf3c5Q8R2T8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gtf3c5Q8R2T8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gtf3c5Q8R2T8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gtf3c5Q8R2T8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gtf3c5Q8R2T8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gtf3c5Q8R2T8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gtf3c5Q8R2T8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Gtf3c5Q8R2T8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gtf3c5Q8R2T8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gtf3c5Q8R2T8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gtf3c5Q8R2T8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gtf3c5Q8R2T8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gtf3c5Q8R2T8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gtf3c5Q8R2T8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gtf3c5Q8R2T8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtf3c5Q8R2T8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtf3c5Q8R2T8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtf3c5Q8R2T8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtf3c5Q8R2T8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtf3c5Q8R2T8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtf3c5Q8R2T8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtf3c5Q8R2T8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtf3c5Q8R2T8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtf3c5Q8R2T8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtf3c5Q8R2T8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtf3c5Q8R2T8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtf3c5Q8R2T8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtf3c5Q8R2T8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtf3c5Q8R2T8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gtf3c5Q8R2T8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gtf3c5Q8R2T8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gtf3c5Q8R2T8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gtf3c5Q8R2T8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gtf3c5Q8R2T8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gtf3c5Q8R2T8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gtf3c5Q8R2T8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gtf3c5Q8R2T8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gtf3c5Q8R2T8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gtf3c5Q8R2T8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gtf3c5Q8R2T8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gtf3c5Q8R2T8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gtf3c5Q8R2T8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gtf3c5Q8R2T8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gtf3c5Q8R2T8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gtf3c5Q8R2T8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gtf3c5Q8R2T8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gtf3c5Q8R2T8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gtf3c5Q8R2T8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gtf3c5Q8R2T8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Gtf3c5Q8R2T8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Gtf3c5Q8R2T8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gtf3c5Q8R2T8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gtf3c5Q8R2T8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gtf3c5Q8R2T8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gtf3c5Q8R2T8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gtf3c5Q8R2T8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gtf3c5Q8R2T8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Gtf3c5Q8R2T8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gtf3c5Q8R2T8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gtf3c5Q8R2T8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gtf3c5Q8R2T8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gtf3c5Q8R2T8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gtf3c5Q8R2T8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gtf3c5Q8R2T8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gtf3c5Q8R2T8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gtf3c5Q8R2T8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gtf3c5Q8R2T8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gtf3c5Q8R2T8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gtf3c5Q8R2T8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.9 ms