Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sf3b4Q8QZY9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sf3b4Q8QZY9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sf3b4Q8QZY9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sf3b4Q8QZY9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sf3b4Q8QZY9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sf3b4Q8QZY9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Sf3b4Q8QZY9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sf3b4Q8QZY9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sf3b4Q8QZY9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sf3b4Q8QZY9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sf3b4Q8QZY9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sf3b4Q8QZY9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sf3b4Q8QZY9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sf3b4Q8QZY9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sf3b4Q8QZY9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sf3b4Q8QZY9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sf3b4Q8QZY9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sf3b4Q8QZY9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sf3b4Q8QZY9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sf3b4Q8QZY9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sf3b4Q8QZY9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sf3b4Q8QZY9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sf3b4Q8QZY9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sf3b4Q8QZY9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sf3b4Q8QZY9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Sf3b4Q8QZY9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sf3b4Q8QZY9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sf3b4Q8QZY9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sf3b4Q8QZY9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sf3b4Q8QZY9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sf3b4Q8QZY9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sf3b4Q8QZY9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sf3b4Q8QZY9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sf3b4Q8QZY9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sf3b4Q8QZY9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sf3b4Q8QZY9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sf3b4Q8QZY9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Sf3b4Q8QZY9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sf3b4Q8QZY9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sf3b4Q8QZY9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sf3b4Q8QZY9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sf3b4Q8QZY9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sf3b4Q8QZY9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sf3b4Q8QZY9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sf3b4Q8QZY9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sf3b4Q8QZY9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sf3b4Q8QZY9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sf3b4Q8QZY9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sf3b4Q8QZY9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sf3b4Q8QZY9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sf3b4Q8QZY9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Sf3b4Q8QZY9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sf3b4Q8QZY9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sf3b4Q8QZY9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sf3b4Q8QZY9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sf3b4Q8QZY9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sf3b4Q8QZY9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sf3b4Q8QZY9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sf3b4Q8QZY9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sf3b4Q8QZY9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sf3b4Q8QZY9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sf3b4Q8QZY9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sf3b4Q8QZY9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sf3b4Q8QZY9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sf3b4Q8QZY9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sf3b4Q8QZY9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sf3b4Q8QZY9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sf3b4Q8QZY9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sf3b4Q8QZY9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sf3b4Q8QZY9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sf3b4Q8QZY9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sf3b4Q8QZY9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sf3b4Q8QZY9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Sf3b4Q8QZY9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Sf3b4Q8QZY9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sf3b4Q8QZY9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sf3b4Q8QZY9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sf3b4Q8QZY9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sf3b4Q8QZY9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sf3b4Q8QZY9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sf3b4Q8QZY9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sf3b4Q8QZY9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sf3b4Q8QZY9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Sf3b4Q8QZY9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Sf3b4Q8QZY9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sf3b4Q8QZY9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sf3b4Q8QZY9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sf3b4Q8QZY9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sf3b4Q8QZY9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sf3b4Q8QZY9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sf3b4Q8QZY9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sf3b4Q8QZY9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sf3b4Q8QZY9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sf3b4Q8QZY9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sf3b4Q8QZY9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sf3b4Q8QZY9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sf3b4Q8QZY9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sf3b4Q8QZY9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sf3b4Q8QZY9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms