Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3V1

Spata4, Spermatogenesis-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata4Q8K3V1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spata4Q8K3V1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spata4Q8K3V1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spata4Q8K3V1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spata4Q8K3V1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spata4Q8K3V1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spata4Q8K3V1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spata4Q8K3V1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spata4Q8K3V1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spata4Q8K3V1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spata4Q8K3V1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spata4Q8K3V1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spata4Q8K3V1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Spata4Q8K3V1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Spata4Q8K3V1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Spata4Q8K3V1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Spata4Q8K3V1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Spata4Q8K3V1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Spata4Q8K3V1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Spata4Q8K3V1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Spata4Q8K3V1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spata4Q8K3V1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spata4Q8K3V1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spata4Q8K3V1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spata4Q8K3V1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spata4Q8K3V1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Spata4Q8K3V1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spata4Q8K3V1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spata4Q8K3V1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spata4Q8K3V1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spata4Q8K3V1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spata4Q8K3V1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spata4Q8K3V1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spata4Q8K3V1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spata4Q8K3V1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spata4Q8K3V1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spata4Q8K3V1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spata4Q8K3V1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spata4Q8K3V1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spata4Q8K3V1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spata4Q8K3V1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spata4Q8K3V1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spata4Q8K3V1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spata4Q8K3V1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spata4Q8K3V1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spata4Q8K3V1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spata4Q8K3V1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spata4Q8K3V1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spata4Q8K3V1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spata4Q8K3V1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spata4Q8K3V1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spata4Q8K3V1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spata4Q8K3V1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spata4Q8K3V1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spata4Q8K3V1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spata4Q8K3V1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spata4Q8K3V1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spata4Q8K3V1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spata4Q8K3V1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spata4Q8K3V1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spata4Q8K3V1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spata4Q8K3V1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spata4Q8K3V1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spata4Q8K3V1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spata4Q8K3V1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spata4Q8K3V1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spata4Q8K3V1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spata4Q8K3V1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Spata4Q8K3V1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Spata4Q8K3V1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Spata4Q8K3V1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Spata4Q8K3V1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Spata4Q8K3V1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Spata4Q8K3V1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spata4Q8K3V1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spata4Q8K3V1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spata4Q8K3V1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spata4Q8K3V1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spata4Q8K3V1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Spata4Q8K3V1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Spata4Q8K3V1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Spata4Q8K3V1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Spata4Q8K3V1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Spata4Q8K3V1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Spata4Q8K3V1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Spata4Q8K3V1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Spata4Q8K3V1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Spata4Q8K3V1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spata4Q8K3V1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spata4Q8K3V1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spata4Q8K3V1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spata4Q8K3V1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spata4Q8K3V1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spata4Q8K3V1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spata4Q8K3V1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spata4Q8K3V1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spata4Q8K3V1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spata4Q8K3V1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Spata4Q8K3V1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spata4Q8K3V1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms