Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Q3

Foxn4, Forkhead box protein N4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn4Q8K3Q3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxn4Q8K3Q3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxn4Q8K3Q3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxn4Q8K3Q3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxn4Q8K3Q3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxn4Q8K3Q3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxn4Q8K3Q3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxn4Q8K3Q3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxn4Q8K3Q3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxn4Q8K3Q3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxn4Q8K3Q3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxn4Q8K3Q3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxn4Q8K3Q3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxn4Q8K3Q3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxn4Q8K3Q3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxn4Q8K3Q3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxn4Q8K3Q3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxn4Q8K3Q3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxn4Q8K3Q3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxn4Q8K3Q3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxn4Q8K3Q3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxn4Q8K3Q3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxn4Q8K3Q3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxn4Q8K3Q3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxn4Q8K3Q3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxn4Q8K3Q3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxn4Q8K3Q3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxn4Q8K3Q3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxn4Q8K3Q3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxn4Q8K3Q3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxn4Q8K3Q3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxn4Q8K3Q3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxn4Q8K3Q3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxn4Q8K3Q3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxn4Q8K3Q3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxn4Q8K3Q3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxn4Q8K3Q3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxn4Q8K3Q3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxn4Q8K3Q3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxn4Q8K3Q3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Foxn4Q8K3Q3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxn4Q8K3Q3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxn4Q8K3Q3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxn4Q8K3Q3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxn4Q8K3Q3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxn4Q8K3Q3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxn4Q8K3Q3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxn4Q8K3Q3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxn4Q8K3Q3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxn4Q8K3Q3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxn4Q8K3Q3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxn4Q8K3Q3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxn4Q8K3Q3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxn4Q8K3Q3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxn4Q8K3Q3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxn4Q8K3Q3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxn4Q8K3Q3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxn4Q8K3Q3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxn4Q8K3Q3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxn4Q8K3Q3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxn4Q8K3Q3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxn4Q8K3Q3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxn4Q8K3Q3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxn4Q8K3Q3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxn4Q8K3Q3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxn4Q8K3Q3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Foxn4Q8K3Q3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Foxn4Q8K3Q3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Foxn4Q8K3Q3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Foxn4Q8K3Q3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Foxn4Q8K3Q3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Foxn4Q8K3Q3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Foxn4Q8K3Q3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Foxn4Q8K3Q3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Foxn4Q8K3Q3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Foxn4Q8K3Q3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Foxn4Q8K3Q3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxn4Q8K3Q3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxn4Q8K3Q3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxn4Q8K3Q3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxn4Q8K3Q3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxn4Q8K3Q3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxn4Q8K3Q3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxn4Q8K3Q3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxn4Q8K3Q3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxn4Q8K3Q3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxn4Q8K3Q3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxn4Q8K3Q3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxn4Q8K3Q3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxn4Q8K3Q3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxn4Q8K3Q3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxn4Q8K3Q3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Foxn4Q8K3Q3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Foxn4Q8K3Q3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Foxn4Q8K3Q3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Foxn4Q8K3Q3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Foxn4Q8K3Q3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Foxn4Q8K3Q3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Foxn4Q8K3Q3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Foxn4Q8K3Q3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms