Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I8

Defb19, Beta-defensin 19, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb19Q8K3I8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Defb19Q8K3I8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Defb19Q8K3I8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Defb19Q8K3I8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Defb19Q8K3I8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Defb19Q8K3I8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Defb19Q8K3I8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Defb19Q8K3I8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Defb19Q8K3I8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Defb19Q8K3I8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Defb19Q8K3I8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Defb19Q8K3I8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Defb19Q8K3I8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Defb19Q8K3I8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Defb19Q8K3I8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Defb19Q8K3I8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Defb19Q8K3I8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Defb19Q8K3I8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Defb19Q8K3I8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Defb19Q8K3I8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Defb19Q8K3I8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Defb19Q8K3I8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Defb19Q8K3I8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Defb19Q8K3I8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Defb19Q8K3I8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Defb19Q8K3I8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Defb19Q8K3I8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Defb19Q8K3I8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Defb19Q8K3I8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Defb19Q8K3I8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Defb19Q8K3I8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Defb19Q8K3I8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Defb19Q8K3I8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Defb19Q8K3I8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Defb19Q8K3I8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Defb19Q8K3I8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Defb19Q8K3I8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Defb19Q8K3I8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Defb19Q8K3I8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Defb19Q8K3I8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Defb19Q8K3I8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Defb19Q8K3I8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Defb19Q8K3I8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Defb19Q8K3I8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Defb19Q8K3I8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Defb19Q8K3I8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Defb19Q8K3I8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Defb19Q8K3I8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Defb19Q8K3I8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Defb19Q8K3I8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Defb19Q8K3I8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Defb19Q8K3I8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Defb19Q8K3I8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Defb19Q8K3I8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Defb19Q8K3I8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Defb19Q8K3I8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Defb19Q8K3I8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Defb19Q8K3I8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Defb19Q8K3I8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Defb19Q8K3I8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Defb19Q8K3I8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Defb19Q8K3I8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Defb19Q8K3I8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Defb19Q8K3I8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Defb19Q8K3I8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Defb19Q8K3I8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Defb19Q8K3I8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Defb19Q8K3I8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Defb19Q8K3I8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Defb19Q8K3I8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Defb19Q8K3I8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Defb19Q8K3I8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Defb19Q8K3I8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Defb19Q8K3I8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Defb19Q8K3I8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Defb19Q8K3I8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Defb19Q8K3I8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Defb19Q8K3I8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Defb19Q8K3I8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Defb19Q8K3I8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Defb19Q8K3I8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Defb19Q8K3I8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Defb19Q8K3I8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Defb19Q8K3I8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Defb19Q8K3I8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Defb19Q8K3I8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Defb19Q8K3I8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Defb19Q8K3I8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Defb19Q8K3I8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Defb19Q8K3I8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Defb19Q8K3I8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Defb19Q8K3I8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Defb19Q8K3I8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Defb19Q8K3I8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Defb19Q8K3I8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Defb19Q8K3I8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Defb19Q8K3I8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Defb19Q8K3I8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Defb19Q8K3I8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Defb19Q8K3I8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms