Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrtm1Q8K377 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrtm1Q8K377 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrtm1Q8K377 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrtm1Q8K377 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrtm1Q8K377 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrtm1Q8K377 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrtm1Q8K377 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrtm1Q8K377 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrtm1Q8K377 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrtm1Q8K377 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrtm1Q8K377 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrtm1Q8K377 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrtm1Q8K377 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrtm1Q8K377 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrtm1Q8K377 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrtm1Q8K377 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrtm1Q8K377 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrtm1Q8K377 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrtm1Q8K377 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrtm1Q8K377 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrtm1Q8K377 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrtm1Q8K377 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrtm1Q8K377 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrtm1Q8K377 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrtm1Q8K377 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrtm1Q8K377 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrtm1Q8K377 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrtm1Q8K377 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Lrrtm1Q8K377 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrtm1Q8K377 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrtm1Q8K377 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrtm1Q8K377 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrtm1Q8K377 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrtm1Q8K377 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrtm1Q8K377 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrtm1Q8K377 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrtm1Q8K377 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrtm1Q8K377 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrtm1Q8K377 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrtm1Q8K377 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrtm1Q8K377 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrtm1Q8K377 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrtm1Q8K377 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrtm1Q8K377 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrtm1Q8K377 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrtm1Q8K377 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrtm1Q8K377 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrtm1Q8K377 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrtm1Q8K377 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrtm1Q8K377 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrtm1Q8K377 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrtm1Q8K377 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrtm1Q8K377 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrtm1Q8K377 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrtm1Q8K377 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrtm1Q8K377 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrtm1Q8K377 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrtm1Q8K377 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrtm1Q8K377 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrtm1Q8K377 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrtm1Q8K377 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrtm1Q8K377 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrtm1Q8K377 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrtm1Q8K377 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrtm1Q8K377 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrtm1Q8K377 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrtm1Q8K377 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrtm1Q8K377 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrtm1Q8K377 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrtm1Q8K377 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrtm1Q8K377 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrtm1Q8K377 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrtm1Q8K377 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrtm1Q8K377 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrtm1Q8K377 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrtm1Q8K377 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrtm1Q8K377 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrtm1Q8K377 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrtm1Q8K377 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrtm1Q8K377 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrtm1Q8K377 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrtm1Q8K377 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrtm1Q8K377 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrtm1Q8K377 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lrrtm1Q8K377 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lrrtm1Q8K377 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lrrtm1Q8K377 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lrrtm1Q8K377 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrtm1Q8K377 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrtm1Q8K377 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrtm1Q8K377 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrtm1Q8K377 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrtm1Q8K377 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrtm1Q8K377 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrtm1Q8K377 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrtm1Q8K377 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrtm1Q8K377 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrtm1Q8K377 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrtm1Q8K377 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms