Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2T8

Paf1, RNA polymerase II-associated factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paf1Q8K2T8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Paf1Q8K2T8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Paf1Q8K2T8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Paf1Q8K2T8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Paf1Q8K2T8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Paf1Q8K2T8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Paf1Q8K2T8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Paf1Q8K2T8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Paf1Q8K2T8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Paf1Q8K2T8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Paf1Q8K2T8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Paf1Q8K2T8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Paf1Q8K2T8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Paf1Q8K2T8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Paf1Q8K2T8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Paf1Q8K2T8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Paf1Q8K2T8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Paf1Q8K2T8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Paf1Q8K2T8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Paf1Q8K2T8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Paf1Q8K2T8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Paf1Q8K2T8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Paf1Q8K2T8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Paf1Q8K2T8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Paf1Q8K2T8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Paf1Q8K2T8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Paf1Q8K2T8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Paf1Q8K2T8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Paf1Q8K2T8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Paf1Q8K2T8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Paf1Q8K2T8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Paf1Q8K2T8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Paf1Q8K2T8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Paf1Q8K2T8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Paf1Q8K2T8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Paf1Q8K2T8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Paf1Q8K2T8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Paf1Q8K2T8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Paf1Q8K2T8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Paf1Q8K2T8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Paf1Q8K2T8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Paf1Q8K2T8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Paf1Q8K2T8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Paf1Q8K2T8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Paf1Q8K2T8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Paf1Q8K2T8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Paf1Q8K2T8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Paf1Q8K2T8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Paf1Q8K2T8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Paf1Q8K2T8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Paf1Q8K2T8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Paf1Q8K2T8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Paf1Q8K2T8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Paf1Q8K2T8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Paf1Q8K2T8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Paf1Q8K2T8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Paf1Q8K2T8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Paf1Q8K2T8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Paf1Q8K2T8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Paf1Q8K2T8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Paf1Q8K2T8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Paf1Q8K2T8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Paf1Q8K2T8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Paf1Q8K2T8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Paf1Q8K2T8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Paf1Q8K2T8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Paf1Q8K2T8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Paf1Q8K2T8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Paf1Q8K2T8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Paf1Q8K2T8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Paf1Q8K2T8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Paf1Q8K2T8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Paf1Q8K2T8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Paf1Q8K2T8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Paf1Q8K2T8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Paf1Q8K2T8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Paf1Q8K2T8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Paf1Q8K2T8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Paf1Q8K2T8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Paf1Q8K2T8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Paf1Q8K2T8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Paf1Q8K2T8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Paf1Q8K2T8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Paf1Q8K2T8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Paf1Q8K2T8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Paf1Q8K2T8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Paf1Q8K2T8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Paf1Q8K2T8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Paf1Q8K2T8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Paf1Q8K2T8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Paf1Q8K2T8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Paf1Q8K2T8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Paf1Q8K2T8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Paf1Q8K2T8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Paf1Q8K2T8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Paf1Q8K2T8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Paf1Q8K2T8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Paf1Q8K2T8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Paf1Q8K2T8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Paf1Q8K2T8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms