Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Abcf3Q8K268 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Abcf3Q8K268 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Abcf3Q8K268 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Abcf3Q8K268 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Abcf3Q8K268 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Abcf3Q8K268 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Abcf3Q8K268 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Abcf3Q8K268 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Abcf3Q8K268 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Abcf3Q8K268 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Abcf3Q8K268 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Abcf3Q8K268 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Abcf3Q8K268 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Abcf3Q8K268 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Abcf3Q8K268 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Abcf3Q8K268 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Abcf3Q8K268 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Abcf3Q8K268 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Abcf3Q8K268 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Abcf3Q8K268 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Abcf3Q8K268 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Abcf3Q8K268 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Abcf3Q8K268 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Abcf3Q8K268 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Abcf3Q8K268 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Abcf3Q8K268 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Abcf3Q8K268 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Abcf3Q8K268 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Abcf3Q8K268 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Abcf3Q8K268 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Abcf3Q8K268 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Abcf3Q8K268 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Abcf3Q8K268 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Abcf3Q8K268 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Abcf3Q8K268 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Abcf3Q8K268 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Abcf3Q8K268 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Abcf3Q8K268 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Abcf3Q8K268 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Abcf3Q8K268 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Abcf3Q8K268 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Abcf3Q8K268 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Abcf3Q8K268 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Abcf3Q8K268 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Abcf3Q8K268 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Abcf3Q8K268 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Abcf3Q8K268 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Abcf3Q8K268 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Abcf3Q8K268 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Abcf3Q8K268 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Abcf3Q8K268 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Abcf3Q8K268 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Abcf3Q8K268 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Abcf3Q8K268 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Abcf3Q8K268 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Abcf3Q8K268 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Abcf3Q8K268 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Abcf3Q8K268 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Abcf3Q8K268 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Abcf3Q8K268 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Abcf3Q8K268 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Abcf3Q8K268 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Abcf3Q8K268 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Abcf3Q8K268 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Abcf3Q8K268 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Abcf3Q8K268 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Abcf3Q8K268 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Abcf3Q8K268 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Abcf3Q8K268 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Abcf3Q8K268 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Abcf3Q8K268 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Abcf3Q8K268 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Abcf3Q8K268 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Abcf3Q8K268 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Abcf3Q8K268 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Abcf3Q8K268 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Abcf3Q8K268 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Abcf3Q8K268 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Abcf3Q8K268 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Abcf3Q8K268 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Abcf3Q8K268 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Abcf3Q8K268 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Abcf3Q8K268 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Abcf3Q8K268 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Abcf3Q8K268 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Abcf3Q8K268 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Abcf3Q8K268 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Abcf3Q8K268 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Abcf3Q8K268 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Abcf3Q8K268 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Abcf3Q8K268 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Abcf3Q8K268 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Abcf3Q8K268 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Abcf3Q8K268 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Abcf3Q8K268 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Abcf3Q8K268 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Abcf3Q8K268 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Abcf3Q8K268 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Abcf3Q8K268 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms