Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1C9

Lrrc41, Leucine-rich repeat-containing protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 807 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc41Q8K1C9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrc41Q8K1C9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrc41Q8K1C9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrc41Q8K1C9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrc41Q8K1C9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrc41Q8K1C9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrc41Q8K1C9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrc41Q8K1C9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrc41Q8K1C9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrc41Q8K1C9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrc41Q8K1C9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrc41Q8K1C9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrc41Q8K1C9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lrrc41Q8K1C9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lrrc41Q8K1C9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc41Q8K1C9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc41Q8K1C9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc41Q8K1C9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc41Q8K1C9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc41Q8K1C9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc41Q8K1C9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc41Q8K1C9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc41Q8K1C9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc41Q8K1C9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc41Q8K1C9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc41Q8K1C9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrrc41Q8K1C9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrrc41Q8K1C9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrrc41Q8K1C9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc41Q8K1C9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc41Q8K1C9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc41Q8K1C9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc41Q8K1C9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc41Q8K1C9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc41Q8K1C9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc41Q8K1C9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc41Q8K1C9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc41Q8K1C9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc41Q8K1C9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc41Q8K1C9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc41Q8K1C9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc41Q8K1C9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc41Q8K1C9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc41Q8K1C9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc41Q8K1C9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc41Q8K1C9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrc41Q8K1C9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrc41Q8K1C9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrc41Q8K1C9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrc41Q8K1C9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrc41Q8K1C9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrc41Q8K1C9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrc41Q8K1C9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrc41Q8K1C9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrc41Q8K1C9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrc41Q8K1C9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrc41Q8K1C9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrc41Q8K1C9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrc41Q8K1C9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc41Q8K1C9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc41Q8K1C9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc41Q8K1C9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc41Q8K1C9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc41Q8K1C9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc41Q8K1C9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc41Q8K1C9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc41Q8K1C9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc41Q8K1C9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc41Q8K1C9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc41Q8K1C9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc41Q8K1C9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc41Q8K1C9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc41Q8K1C9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc41Q8K1C9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc41Q8K1C9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc41Q8K1C9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc41Q8K1C9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc41Q8K1C9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc41Q8K1C9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc41Q8K1C9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc41Q8K1C9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc41Q8K1C9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc41Q8K1C9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc41Q8K1C9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc41Q8K1C9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc41Q8K1C9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc41Q8K1C9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc41Q8K1C9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc41Q8K1C9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc41Q8K1C9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc41Q8K1C9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc41Q8K1C9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc41Q8K1C9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc41Q8K1C9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc41Q8K1C9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc41Q8K1C9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc41Q8K1C9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc41Q8K1C9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc41Q8K1C9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc41Q8K1C9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms