Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn34c1Q8K193 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn34c1Q8K193 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn34c1Q8K193 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn34c1Q8K193 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn34c1Q8K193 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn34c1Q8K193 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn34c1Q8K193 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn34c1Q8K193 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn34c1Q8K193 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn34c1Q8K193 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn34c1Q8K193 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34c1Q8K193 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34c1Q8K193 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34c1Q8K193 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34c1Q8K193 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34c1Q8K193 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34c1Q8K193 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34c1Q8K193 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34c1Q8K193 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34c1Q8K193 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34c1Q8K193 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34c1Q8K193 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34c1Q8K193 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34c1Q8K193 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34c1Q8K193 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34c1Q8K193 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34c1Q8K193 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34c1Q8K193 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34c1Q8K193 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34c1Q8K193 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Cldn34c1Q8K193 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34c1Q8K193 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Cldn34c1Q8K193 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Cldn34c1Q8K193 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34c1Q8K193 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34c1Q8K193 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34c1Q8K193 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34c1Q8K193 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34c1Q8K193 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34c1Q8K193 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
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Cldn34c1Q8K193 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn34c1Q8K193 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn34c1Q8K193 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn34c1Q8K193 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn34c1Q8K193 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn34c1Q8K193 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn34c1Q8K193 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn34c1Q8K193 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn34c1Q8K193 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn34c1Q8K193 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn34c1Q8K193 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34c1Q8K193 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34c1Q8K193 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34c1Q8K193 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Cldn34c1Q8K193 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34c1Q8K193 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34c1Q8K193 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34c1Q8K193 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Cldn34c1Q8K193 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34c1Q8K193 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Cldn34c1Q8K193 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34c1Q8K193 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34c1Q8K193 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34c1Q8K193 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34c1Q8K193 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34c1Q8K193 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34c1Q8K193 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34c1Q8K193 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34c1Q8K193 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34c1Q8K193 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34c1Q8K193 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34c1Q8K193 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34c1Q8K193 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34c1Q8K193 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34c1Q8K193 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34c1Q8K193 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34c1Q8K193 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34c1Q8K193 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34c1Q8K193 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34c1Q8K193 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34c1Q8K193 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34c1Q8K193 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34c1Q8K193 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34c1Q8K193 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34c1Q8K193 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34c1Q8K193 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34c1Q8K193 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34c1Q8K193 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34c1Q8K193 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms