Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0W3

Rnf208, RING finger protein 208, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf208Q8K0W3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf208Q8K0W3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf208Q8K0W3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf208Q8K0W3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf208Q8K0W3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf208Q8K0W3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf208Q8K0W3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf208Q8K0W3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf208Q8K0W3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf208Q8K0W3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf208Q8K0W3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf208Q8K0W3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf208Q8K0W3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf208Q8K0W3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf208Q8K0W3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf208Q8K0W3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf208Q8K0W3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf208Q8K0W3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf208Q8K0W3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf208Q8K0W3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf208Q8K0W3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf208Q8K0W3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf208Q8K0W3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf208Q8K0W3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf208Q8K0W3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf208Q8K0W3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf208Q8K0W3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf208Q8K0W3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf208Q8K0W3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf208Q8K0W3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf208Q8K0W3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf208Q8K0W3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf208Q8K0W3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf208Q8K0W3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf208Q8K0W3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf208Q8K0W3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf208Q8K0W3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf208Q8K0W3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf208Q8K0W3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf208Q8K0W3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf208Q8K0W3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf208Q8K0W3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf208Q8K0W3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf208Q8K0W3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf208Q8K0W3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf208Q8K0W3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf208Q8K0W3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf208Q8K0W3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf208Q8K0W3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf208Q8K0W3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf208Q8K0W3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf208Q8K0W3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf208Q8K0W3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf208Q8K0W3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf208Q8K0W3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf208Q8K0W3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf208Q8K0W3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf208Q8K0W3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf208Q8K0W3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf208Q8K0W3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf208Q8K0W3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf208Q8K0W3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf208Q8K0W3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf208Q8K0W3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf208Q8K0W3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf208Q8K0W3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf208Q8K0W3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf208Q8K0W3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf208Q8K0W3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf208Q8K0W3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf208Q8K0W3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf208Q8K0W3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf208Q8K0W3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf208Q8K0W3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf208Q8K0W3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf208Q8K0W3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf208Q8K0W3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf208Q8K0W3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf208Q8K0W3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf208Q8K0W3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf208Q8K0W3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf208Q8K0W3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf208Q8K0W3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf208Q8K0W3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf208Q8K0W3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf208Q8K0W3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf208Q8K0W3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf208Q8K0W3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf208Q8K0W3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf208Q8K0W3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf208Q8K0W3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf208Q8K0W3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf208Q8K0W3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf208Q8K0W3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf208Q8K0W3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf208Q8K0W3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf208Q8K0W3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf208Q8K0W3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf208Q8K0W3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf208Q8K0W3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms