Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LgsnQ8CIX8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LgsnQ8CIX8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LgsnQ8CIX8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LgsnQ8CIX8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LgsnQ8CIX8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LgsnQ8CIX8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LgsnQ8CIX8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LgsnQ8CIX8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LgsnQ8CIX8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LgsnQ8CIX8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LgsnQ8CIX8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LgsnQ8CIX8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LgsnQ8CIX8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LgsnQ8CIX8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LgsnQ8CIX8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LgsnQ8CIX8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LgsnQ8CIX8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LgsnQ8CIX8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LgsnQ8CIX8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LgsnQ8CIX8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LgsnQ8CIX8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LgsnQ8CIX8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LgsnQ8CIX8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LgsnQ8CIX8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LgsnQ8CIX8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LgsnQ8CIX8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LgsnQ8CIX8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LgsnQ8CIX8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LgsnQ8CIX8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LgsnQ8CIX8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LgsnQ8CIX8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LgsnQ8CIX8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LgsnQ8CIX8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LgsnQ8CIX8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LgsnQ8CIX8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LgsnQ8CIX8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LgsnQ8CIX8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LgsnQ8CIX8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LgsnQ8CIX8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LgsnQ8CIX8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LgsnQ8CIX8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LgsnQ8CIX8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LgsnQ8CIX8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LgsnQ8CIX8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LgsnQ8CIX8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LgsnQ8CIX8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LgsnQ8CIX8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LgsnQ8CIX8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LgsnQ8CIX8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LgsnQ8CIX8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LgsnQ8CIX8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LgsnQ8CIX8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LgsnQ8CIX8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LgsnQ8CIX8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LgsnQ8CIX8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LgsnQ8CIX8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LgsnQ8CIX8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LgsnQ8CIX8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LgsnQ8CIX8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LgsnQ8CIX8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LgsnQ8CIX8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LgsnQ8CIX8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LgsnQ8CIX8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LgsnQ8CIX8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LgsnQ8CIX8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LgsnQ8CIX8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LgsnQ8CIX8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LgsnQ8CIX8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LgsnQ8CIX8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LgsnQ8CIX8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LgsnQ8CIX8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LgsnQ8CIX8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LgsnQ8CIX8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LgsnQ8CIX8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LgsnQ8CIX8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LgsnQ8CIX8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LgsnQ8CIX8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LgsnQ8CIX8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LgsnQ8CIX8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LgsnQ8CIX8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LgsnQ8CIX8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LgsnQ8CIX8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LgsnQ8CIX8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LgsnQ8CIX8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LgsnQ8CIX8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LgsnQ8CIX8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LgsnQ8CIX8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LgsnQ8CIX8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LgsnQ8CIX8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LgsnQ8CIX8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LgsnQ8CIX8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LgsnQ8CIX8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LgsnQ8CIX8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LgsnQ8CIX8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LgsnQ8CIX8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LgsnQ8CIX8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LgsnQ8CIX8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LgsnQ8CIX8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LgsnQ8CIX8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms