Protein–RNA interactions for Protein: Q8CII8

Syne4, Nesprin-4, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne4Q8CII8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Syne4Q8CII8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Syne4Q8CII8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Syne4Q8CII8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Syne4Q8CII8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Syne4Q8CII8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Syne4Q8CII8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Syne4Q8CII8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Syne4Q8CII8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Syne4Q8CII8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Syne4Q8CII8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Syne4Q8CII8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Syne4Q8CII8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Syne4Q8CII8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Syne4Q8CII8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Syne4Q8CII8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Syne4Q8CII8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Syne4Q8CII8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Syne4Q8CII8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Syne4Q8CII8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Syne4Q8CII8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Syne4Q8CII8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Syne4Q8CII8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Syne4Q8CII8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Syne4Q8CII8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Syne4Q8CII8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Syne4Q8CII8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Syne4Q8CII8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Syne4Q8CII8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Syne4Q8CII8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Syne4Q8CII8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Syne4Q8CII8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Syne4Q8CII8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Syne4Q8CII8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Syne4Q8CII8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Syne4Q8CII8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Syne4Q8CII8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Syne4Q8CII8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Syne4Q8CII8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Syne4Q8CII8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Syne4Q8CII8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Syne4Q8CII8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Syne4Q8CII8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Syne4Q8CII8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Syne4Q8CII8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Syne4Q8CII8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Syne4Q8CII8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Syne4Q8CII8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Syne4Q8CII8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Syne4Q8CII8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Syne4Q8CII8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Syne4Q8CII8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Syne4Q8CII8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Syne4Q8CII8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Syne4Q8CII8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Syne4Q8CII8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Syne4Q8CII8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Syne4Q8CII8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Syne4Q8CII8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Syne4Q8CII8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Syne4Q8CII8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Syne4Q8CII8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Syne4Q8CII8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Syne4Q8CII8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Syne4Q8CII8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Syne4Q8CII8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syne4Q8CII8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syne4Q8CII8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syne4Q8CII8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syne4Q8CII8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syne4Q8CII8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syne4Q8CII8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syne4Q8CII8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syne4Q8CII8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syne4Q8CII8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syne4Q8CII8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syne4Q8CII8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Syne4Q8CII8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Syne4Q8CII8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Syne4Q8CII8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Syne4Q8CII8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Syne4Q8CII8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Syne4Q8CII8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Syne4Q8CII8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Syne4Q8CII8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Syne4Q8CII8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Syne4Q8CII8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Syne4Q8CII8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Syne4Q8CII8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Syne4Q8CII8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Syne4Q8CII8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Syne4Q8CII8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Syne4Q8CII8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Syne4Q8CII8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Syne4Q8CII8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Syne4Q8CII8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Syne4Q8CII8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Syne4Q8CII8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Syne4Q8CII8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Syne4Q8CII8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms