Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGV2

Tph2, Tryptophan 5-hydroxylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tph2Q8CGV2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tph2Q8CGV2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tph2Q8CGV2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tph2Q8CGV2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tph2Q8CGV2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tph2Q8CGV2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Tph2Q8CGV2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tph2Q8CGV2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tph2Q8CGV2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tph2Q8CGV2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tph2Q8CGV2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tph2Q8CGV2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tph2Q8CGV2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Tph2Q8CGV2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tph2Q8CGV2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tph2Q8CGV2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tph2Q8CGV2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tph2Q8CGV2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Tph2Q8CGV2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tph2Q8CGV2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tph2Q8CGV2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tph2Q8CGV2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tph2Q8CGV2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tph2Q8CGV2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tph2Q8CGV2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tph2Q8CGV2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tph2Q8CGV2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tph2Q8CGV2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tph2Q8CGV2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tph2Q8CGV2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tph2Q8CGV2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tph2Q8CGV2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tph2Q8CGV2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tph2Q8CGV2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tph2Q8CGV2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tph2Q8CGV2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tph2Q8CGV2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tph2Q8CGV2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Tph2Q8CGV2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tph2Q8CGV2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tph2Q8CGV2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tph2Q8CGV2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tph2Q8CGV2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tph2Q8CGV2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tph2Q8CGV2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tph2Q8CGV2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tph2Q8CGV2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tph2Q8CGV2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tph2Q8CGV2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tph2Q8CGV2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tph2Q8CGV2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tph2Q8CGV2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tph2Q8CGV2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Tph2Q8CGV2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tph2Q8CGV2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tph2Q8CGV2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tph2Q8CGV2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tph2Q8CGV2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tph2Q8CGV2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tph2Q8CGV2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tph2Q8CGV2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tph2Q8CGV2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tph2Q8CGV2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tph2Q8CGV2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tph2Q8CGV2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tph2Q8CGV2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tph2Q8CGV2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tph2Q8CGV2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tph2Q8CGV2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Tph2Q8CGV2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tph2Q8CGV2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tph2Q8CGV2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tph2Q8CGV2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tph2Q8CGV2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tph2Q8CGV2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tph2Q8CGV2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tph2Q8CGV2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tph2Q8CGV2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tph2Q8CGV2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tph2Q8CGV2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tph2Q8CGV2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tph2Q8CGV2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tph2Q8CGV2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tph2Q8CGV2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tph2Q8CGV2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tph2Q8CGV2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tph2Q8CGV2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tph2Q8CGV2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Tph2Q8CGV2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tph2Q8CGV2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tph2Q8CGV2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tph2Q8CGV2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tph2Q8CGV2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tph2Q8CGV2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tph2Q8CGV2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tph2Q8CGV2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tph2Q8CGV2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tph2Q8CGV2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tph2Q8CGV2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tph2Q8CGV2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms