Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cdkl1Q8CEQ0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cdkl1Q8CEQ0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cdkl1Q8CEQ0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Cdkl1Q8CEQ0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cdkl1Q8CEQ0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cdkl1Q8CEQ0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cdkl1Q8CEQ0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cdkl1Q8CEQ0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cdkl1Q8CEQ0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms