Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCX5

Krt222, Keratin-like protein KRT222, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt222Q8CCX5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt222Q8CCX5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt222Q8CCX5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt222Q8CCX5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt222Q8CCX5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt222Q8CCX5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt222Q8CCX5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt222Q8CCX5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt222Q8CCX5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt222Q8CCX5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt222Q8CCX5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt222Q8CCX5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt222Q8CCX5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt222Q8CCX5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt222Q8CCX5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Krt222Q8CCX5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Krt222Q8CCX5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Krt222Q8CCX5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Krt222Q8CCX5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Krt222Q8CCX5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt222Q8CCX5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt222Q8CCX5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt222Q8CCX5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt222Q8CCX5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt222Q8CCX5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt222Q8CCX5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt222Q8CCX5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt222Q8CCX5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt222Q8CCX5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt222Q8CCX5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt222Q8CCX5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt222Q8CCX5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt222Q8CCX5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt222Q8CCX5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt222Q8CCX5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt222Q8CCX5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt222Q8CCX5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt222Q8CCX5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt222Q8CCX5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt222Q8CCX5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt222Q8CCX5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt222Q8CCX5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt222Q8CCX5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt222Q8CCX5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt222Q8CCX5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt222Q8CCX5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt222Q8CCX5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt222Q8CCX5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt222Q8CCX5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt222Q8CCX5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt222Q8CCX5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt222Q8CCX5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt222Q8CCX5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt222Q8CCX5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt222Q8CCX5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt222Q8CCX5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt222Q8CCX5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt222Q8CCX5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt222Q8CCX5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt222Q8CCX5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt222Q8CCX5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt222Q8CCX5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt222Q8CCX5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt222Q8CCX5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt222Q8CCX5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt222Q8CCX5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt222Q8CCX5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt222Q8CCX5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt222Q8CCX5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt222Q8CCX5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt222Q8CCX5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt222Q8CCX5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt222Q8CCX5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt222Q8CCX5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt222Q8CCX5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Krt222Q8CCX5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Krt222Q8CCX5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt222Q8CCX5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Krt222Q8CCX5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt222Q8CCX5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt222Q8CCX5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt222Q8CCX5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt222Q8CCX5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt222Q8CCX5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt222Q8CCX5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Krt222Q8CCX5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt222Q8CCX5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt222Q8CCX5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt222Q8CCX5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt222Q8CCX5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt222Q8CCX5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt222Q8CCX5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Krt222Q8CCX5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Krt222Q8CCX5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Krt222Q8CCX5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt222Q8CCX5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt222Q8CCX5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt222Q8CCX5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt222Q8CCX5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
Krt222Q8CCX5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms