Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCN5

Bcas3, Breast carcinoma-amplified sequence 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 928 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcas3Q8CCN5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bcas3Q8CCN5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bcas3Q8CCN5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bcas3Q8CCN5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bcas3Q8CCN5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bcas3Q8CCN5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bcas3Q8CCN5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bcas3Q8CCN5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bcas3Q8CCN5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bcas3Q8CCN5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bcas3Q8CCN5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bcas3Q8CCN5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bcas3Q8CCN5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bcas3Q8CCN5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bcas3Q8CCN5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Bcas3Q8CCN5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bcas3Q8CCN5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bcas3Q8CCN5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bcas3Q8CCN5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bcas3Q8CCN5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bcas3Q8CCN5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Bcas3Q8CCN5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bcas3Q8CCN5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bcas3Q8CCN5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bcas3Q8CCN5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bcas3Q8CCN5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bcas3Q8CCN5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bcas3Q8CCN5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bcas3Q8CCN5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bcas3Q8CCN5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bcas3Q8CCN5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bcas3Q8CCN5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bcas3Q8CCN5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bcas3Q8CCN5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bcas3Q8CCN5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Bcas3Q8CCN5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bcas3Q8CCN5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bcas3Q8CCN5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bcas3Q8CCN5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bcas3Q8CCN5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bcas3Q8CCN5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bcas3Q8CCN5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bcas3Q8CCN5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bcas3Q8CCN5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bcas3Q8CCN5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bcas3Q8CCN5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bcas3Q8CCN5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bcas3Q8CCN5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bcas3Q8CCN5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bcas3Q8CCN5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Bcas3Q8CCN5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bcas3Q8CCN5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bcas3Q8CCN5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bcas3Q8CCN5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bcas3Q8CCN5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bcas3Q8CCN5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Bcas3Q8CCN5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bcas3Q8CCN5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bcas3Q8CCN5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bcas3Q8CCN5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bcas3Q8CCN5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bcas3Q8CCN5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bcas3Q8CCN5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bcas3Q8CCN5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bcas3Q8CCN5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Bcas3Q8CCN5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bcas3Q8CCN5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bcas3Q8CCN5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bcas3Q8CCN5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bcas3Q8CCN5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Bcas3Q8CCN5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bcas3Q8CCN5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Bcas3Q8CCN5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bcas3Q8CCN5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Bcas3Q8CCN5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bcas3Q8CCN5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bcas3Q8CCN5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bcas3Q8CCN5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bcas3Q8CCN5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bcas3Q8CCN5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bcas3Q8CCN5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bcas3Q8CCN5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bcas3Q8CCN5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bcas3Q8CCN5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bcas3Q8CCN5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bcas3Q8CCN5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bcas3Q8CCN5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bcas3Q8CCN5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bcas3Q8CCN5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bcas3Q8CCN5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bcas3Q8CCN5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bcas3Q8CCN5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bcas3Q8CCN5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bcas3Q8CCN5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bcas3Q8CCN5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bcas3Q8CCN5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bcas3Q8CCN5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
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Bcas3Q8CCN5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bcas3Q8CCN5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
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