Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ3

Ufl1, E3 UFM1-protein ligase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufl1Q8CCJ3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ufl1Q8CCJ3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ufl1Q8CCJ3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ufl1Q8CCJ3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ufl1Q8CCJ3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ufl1Q8CCJ3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ufl1Q8CCJ3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ufl1Q8CCJ3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ufl1Q8CCJ3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ufl1Q8CCJ3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ufl1Q8CCJ3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ufl1Q8CCJ3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ufl1Q8CCJ3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ufl1Q8CCJ3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ufl1Q8CCJ3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ufl1Q8CCJ3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ufl1Q8CCJ3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ufl1Q8CCJ3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ufl1Q8CCJ3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ufl1Q8CCJ3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ufl1Q8CCJ3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ufl1Q8CCJ3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ufl1Q8CCJ3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ufl1Q8CCJ3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ufl1Q8CCJ3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ufl1Q8CCJ3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ufl1Q8CCJ3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ufl1Q8CCJ3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ufl1Q8CCJ3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ufl1Q8CCJ3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ufl1Q8CCJ3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ufl1Q8CCJ3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ufl1Q8CCJ3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ufl1Q8CCJ3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ufl1Q8CCJ3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ufl1Q8CCJ3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ufl1Q8CCJ3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ufl1Q8CCJ3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ufl1Q8CCJ3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ufl1Q8CCJ3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ufl1Q8CCJ3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ufl1Q8CCJ3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ufl1Q8CCJ3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ufl1Q8CCJ3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ufl1Q8CCJ3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Ufl1Q8CCJ3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ufl1Q8CCJ3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ufl1Q8CCJ3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ufl1Q8CCJ3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ufl1Q8CCJ3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ufl1Q8CCJ3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ufl1Q8CCJ3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ufl1Q8CCJ3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ufl1Q8CCJ3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ufl1Q8CCJ3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ufl1Q8CCJ3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ufl1Q8CCJ3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ufl1Q8CCJ3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ufl1Q8CCJ3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ufl1Q8CCJ3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ufl1Q8CCJ3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ufl1Q8CCJ3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ufl1Q8CCJ3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ufl1Q8CCJ3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ufl1Q8CCJ3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ufl1Q8CCJ3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ufl1Q8CCJ3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ufl1Q8CCJ3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ufl1Q8CCJ3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ufl1Q8CCJ3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ufl1Q8CCJ3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ufl1Q8CCJ3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ufl1Q8CCJ3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ufl1Q8CCJ3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ufl1Q8CCJ3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ufl1Q8CCJ3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ufl1Q8CCJ3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ufl1Q8CCJ3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ufl1Q8CCJ3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ufl1Q8CCJ3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ufl1Q8CCJ3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ufl1Q8CCJ3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ufl1Q8CCJ3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ufl1Q8CCJ3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ufl1Q8CCJ3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ufl1Q8CCJ3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ufl1Q8CCJ3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ufl1Q8CCJ3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ufl1Q8CCJ3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ufl1Q8CCJ3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ufl1Q8CCJ3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ufl1Q8CCJ3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ufl1Q8CCJ3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ufl1Q8CCJ3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ufl1Q8CCJ3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ufl1Q8CCJ3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ufl1Q8CCJ3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ufl1Q8CCJ3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ufl1Q8CCJ3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ufl1Q8CCJ3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms