Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nrip1Q8CBD1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nrip1Q8CBD1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nrip1Q8CBD1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nrip1Q8CBD1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nrip1Q8CBD1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nrip1Q8CBD1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nrip1Q8CBD1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nrip1Q8CBD1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nrip1Q8CBD1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nrip1Q8CBD1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nrip1Q8CBD1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Nrip1Q8CBD1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nrip1Q8CBD1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nrip1Q8CBD1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nrip1Q8CBD1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nrip1Q8CBD1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nrip1Q8CBD1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Nrip1Q8CBD1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nrip1Q8CBD1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nrip1Q8CBD1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nrip1Q8CBD1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nrip1Q8CBD1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nrip1Q8CBD1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nrip1Q8CBD1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nrip1Q8CBD1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nrip1Q8CBD1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nrip1Q8CBD1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nrip1Q8CBD1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nrip1Q8CBD1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Nrip1Q8CBD1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nrip1Q8CBD1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nrip1Q8CBD1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nrip1Q8CBD1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nrip1Q8CBD1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nrip1Q8CBD1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nrip1Q8CBD1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nrip1Q8CBD1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nrip1Q8CBD1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Nrip1Q8CBD1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Nrip1Q8CBD1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nrip1Q8CBD1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nrip1Q8CBD1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nrip1Q8CBD1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nrip1Q8CBD1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nrip1Q8CBD1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nrip1Q8CBD1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nrip1Q8CBD1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nrip1Q8CBD1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nrip1Q8CBD1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nrip1Q8CBD1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nrip1Q8CBD1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nrip1Q8CBD1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nrip1Q8CBD1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nrip1Q8CBD1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nrip1Q8CBD1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nrip1Q8CBD1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nrip1Q8CBD1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nrip1Q8CBD1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nrip1Q8CBD1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Nrip1Q8CBD1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nrip1Q8CBD1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Nrip1Q8CBD1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nrip1Q8CBD1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nrip1Q8CBD1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nrip1Q8CBD1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nrip1Q8CBD1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nrip1Q8CBD1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nrip1Q8CBD1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nrip1Q8CBD1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nrip1Q8CBD1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Nrip1Q8CBD1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nrip1Q8CBD1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nrip1Q8CBD1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nrip1Q8CBD1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Nrip1Q8CBD1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Nrip1Q8CBD1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nrip1Q8CBD1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nrip1Q8CBD1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nrip1Q8CBD1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nrip1Q8CBD1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nrip1Q8CBD1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nrip1Q8CBD1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Nrip1Q8CBD1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nrip1Q8CBD1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nrip1Q8CBD1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nrip1Q8CBD1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nrip1Q8CBD1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nrip1Q8CBD1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nrip1Q8CBD1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nrip1Q8CBD1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nrip1Q8CBD1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nrip1Q8CBD1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Nrip1Q8CBD1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nrip1Q8CBD1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nrip1Q8CBD1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nrip1Q8CBD1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nrip1Q8CBD1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nrip1Q8CBD1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nrip1Q8CBD1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms