Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB19

Phtf2, Putative homeodomain transcription factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf2Q8CB19 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Phtf2Q8CB19 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Phtf2Q8CB19 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Phtf2Q8CB19 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Phtf2Q8CB19 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Phtf2Q8CB19 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Phtf2Q8CB19 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Phtf2Q8CB19 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Phtf2Q8CB19 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Phtf2Q8CB19 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Phtf2Q8CB19 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Phtf2Q8CB19 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Phtf2Q8CB19 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Phtf2Q8CB19 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Phtf2Q8CB19 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Phtf2Q8CB19 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Phtf2Q8CB19 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Phtf2Q8CB19 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Phtf2Q8CB19 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Phtf2Q8CB19 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Phtf2Q8CB19 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Phtf2Q8CB19 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Phtf2Q8CB19 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Phtf2Q8CB19 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Phtf2Q8CB19 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Phtf2Q8CB19 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Phtf2Q8CB19 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Phtf2Q8CB19 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Phtf2Q8CB19 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Phtf2Q8CB19 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Phtf2Q8CB19 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Phtf2Q8CB19 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Phtf2Q8CB19 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Phtf2Q8CB19 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Phtf2Q8CB19 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Phtf2Q8CB19 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Phtf2Q8CB19 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Phtf2Q8CB19 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Phtf2Q8CB19 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Phtf2Q8CB19 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Phtf2Q8CB19 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Phtf2Q8CB19 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Phtf2Q8CB19 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Phtf2Q8CB19 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Phtf2Q8CB19 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Phtf2Q8CB19 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Phtf2Q8CB19 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Phtf2Q8CB19 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Phtf2Q8CB19 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Phtf2Q8CB19 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Phtf2Q8CB19 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Phtf2Q8CB19 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Phtf2Q8CB19 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Phtf2Q8CB19 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Phtf2Q8CB19 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Phtf2Q8CB19 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Phtf2Q8CB19 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Phtf2Q8CB19 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Phtf2Q8CB19 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Phtf2Q8CB19 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Phtf2Q8CB19 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Phtf2Q8CB19 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Phtf2Q8CB19 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Phtf2Q8CB19 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Phtf2Q8CB19 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Phtf2Q8CB19 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Phtf2Q8CB19 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Phtf2Q8CB19 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Phtf2Q8CB19 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Phtf2Q8CB19 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Phtf2Q8CB19 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Phtf2Q8CB19 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Phtf2Q8CB19 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Phtf2Q8CB19 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Phtf2Q8CB19 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Phtf2Q8CB19 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Phtf2Q8CB19 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Phtf2Q8CB19 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phtf2Q8CB19 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Phtf2Q8CB19 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phtf2Q8CB19 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phtf2Q8CB19 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phtf2Q8CB19 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phtf2Q8CB19 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phtf2Q8CB19 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phtf2Q8CB19 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phtf2Q8CB19 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Phtf2Q8CB19 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phtf2Q8CB19 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phtf2Q8CB19 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Phtf2Q8CB19 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Phtf2Q8CB19 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Phtf2Q8CB19 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Phtf2Q8CB19 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Phtf2Q8CB19 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Phtf2Q8CB19 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Phtf2Q8CB19 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Phtf2Q8CB19 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Phtf2Q8CB19 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Phtf2Q8CB19 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms